44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1653 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  895    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  30.31 
 
 		 454 aa  123  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  29.02 
 
 		 366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  28.28 
 
 		 481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  31.01 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  29.57 
 
 		 374 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  29.57 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  29.03 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  28.64 
 
 		 481 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  28.88 
 
 		 481 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  29.12 
 
 		 481 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  29.56 
 
 		 450 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  29.8 
 
 		 374 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  29.28 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  27.99 
 
 		 481 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  27.6 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  30.17 
 
 		 600 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  27.68 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  28.64 
 
 		 482 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  28.98 
 
 		 485 aa  103  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  28.97 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  26.93 
 
 		 473 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  28.73 
 
 		 374 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  30 
 
 		 477 aa  97.4  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  29.12 
 
 		 374 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  29.12 
 
 		 374 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  26.87 
 
 		 597 aa  94  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  26.79 
 
 		 600 aa  93.6  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  28.42 
 
 		 374 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  25.81 
 
 		 483 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  27.01 
 
 		 474 aa  90.9  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  27.21 
 
 		 597 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  26.57 
 
 		 597 aa  89.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  27.64 
 
 		 494 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17341  hypothetical protein  23.36 
 
 		 453 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  29.13 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1022 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1349  hypothetical protein  24.71 
 
 		 488 aa  50.1  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0777  hypothetical protein  34.65 
 
 		 310 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3106  hypothetical protein  32.59 
 
 		 351 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000218303  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  34.19 
 
 		 486 aa  47.8  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1462  Arylsulfotransferase  26.33 
 
 		 524 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0407  hypothetical protein  25.52 
 
 		 447 aa  45.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.342739 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3530  hypothetical protein  31.61 
 
 		 450 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>