50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4630 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  761    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  82.75 
 
 
376 aa  639    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  82.88 
 
 
374 aa  630  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  83.15 
 
 
374 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  82.93 
 
 
374 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  82.93 
 
 
374 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  57.84 
 
 
374 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  57.84 
 
 
374 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  57.84 
 
 
374 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  57.57 
 
 
374 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  57.57 
 
 
374 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  45.82 
 
 
377 aa  316  5e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  41.3 
 
 
366 aa  297  2e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  29.1 
 
 
481 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  30.05 
 
 
399 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  27.52 
 
 
481 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  26.82 
 
 
473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  28.09 
 
 
597 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  29.16 
 
 
600 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  26.24 
 
 
481 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  28.61 
 
 
597 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  28.83 
 
 
454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  25.74 
 
 
481 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  30.94 
 
 
450 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  27.54 
 
 
485 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  27.87 
 
 
597 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  26.26 
 
 
481 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  25.91 
 
 
474 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  27.6 
 
 
439 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  26.8 
 
 
483 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  24.43 
 
 
600 aa  105  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  25.85 
 
 
482 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  27.07 
 
 
1022 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  26.57 
 
 
494 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  25.33 
 
 
477 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3457  hypothetical protein  32.38 
 
 
618 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  24.51 
 
 
915 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  30.81 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0407  hypothetical protein  25.68 
 
 
447 aa  69.7  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.342739 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  30.51 
 
 
486 aa  63.9  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1599  Arylsulfotransferase  24.53 
 
 
562 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4788  hypothetical protein  25.64 
 
 
514 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.927804  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0171  Arylsulfotransferase  24.36 
 
 
626 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2062  hypothetical protein  27.72 
 
 
545 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05465  conserved hypothetical protein  31.65 
 
 
690 aa  46.6  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548689  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1349  hypothetical protein  21.65 
 
 
488 aa  46.2  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3530  hypothetical protein  26.61 
 
 
450 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3106  hypothetical protein  27.37 
 
 
351 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000218303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1756  hypothetical protein  32.77 
 
 
614 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2404  Arylsulfotransferase  23.51 
 
 
1349 aa  44.3  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>