48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0315 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  764    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  48.79 
 
 
366 aa  356  5e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  47.44 
 
 
374 aa  332  6e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  47.98 
 
 
374 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  47.98 
 
 
374 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  47.98 
 
 
374 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  46.42 
 
 
376 aa  326  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  45.23 
 
 
374 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  44.96 
 
 
374 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  44.96 
 
 
374 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  44.69 
 
 
374 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  44.96 
 
 
374 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  45.82 
 
 
371 aa  316  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  28.25 
 
 
481 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  32.05 
 
 
450 aa  115  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  31.01 
 
 
439 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  29.47 
 
 
1022 aa  112  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  25.75 
 
 
473 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  32.12 
 
 
600 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  27.55 
 
 
481 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  30 
 
 
482 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  27.39 
 
 
474 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  30.29 
 
 
600 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  28.1 
 
 
399 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  27.08 
 
 
481 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  30.66 
 
 
597 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  26.98 
 
 
481 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  30.18 
 
 
481 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  27.15 
 
 
454 aa  102  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  29.67 
 
 
483 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  30.66 
 
 
597 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  30.66 
 
 
597 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  30.55 
 
 
485 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  31.27 
 
 
494 aa  97.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  30.29 
 
 
477 aa  93.2  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  25.6 
 
 
915 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  28.8 
 
 
434 aa  69.7  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0407  hypothetical protein  27.14 
 
 
447 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.342739 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  30.34 
 
 
486 aa  55.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2404  Arylsulfotransferase  28.21 
 
 
1349 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4788  hypothetical protein  22.52 
 
 
514 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.927804  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1599  Arylsulfotransferase  25.5 
 
 
562 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3734  Arylsulfotransferase  27.27 
 
 
628 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02186  conserved hypothetical protein  24.45 
 
 
572 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0354311  normal  0.214267 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2062  hypothetical protein  27.84 
 
 
545 aa  44.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3530  hypothetical protein  28.28 
 
 
450 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3457  hypothetical protein  25.91 
 
 
618 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0777  hypothetical protein  32.63 
 
 
310 aa  43.1  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>