23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0777 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0777  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  641    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3106  hypothetical protein  30.3 
 
 
351 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000218303  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  29.87 
 
 
434 aa  53.1  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  21.91 
 
 
487 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  31.3 
 
 
454 aa  50.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  34.65 
 
 
439 aa  49.7  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  47.37 
 
 
450 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  42.47 
 
 
486 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  48.21 
 
 
477 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  28.38 
 
 
376 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  64.52 
 
 
485 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  28.51 
 
 
374 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  28.51 
 
 
374 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  64.52 
 
 
474 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  28.05 
 
 
374 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  42.86 
 
 
399 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  40.68 
 
 
481 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  32.63 
 
 
377 aa  43.1  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  43.75 
 
 
494 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  28.11 
 
 
374 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  45.45 
 
 
482 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  24.79 
 
 
374 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  24.79 
 
 
374 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>