48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1412 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  67.5 
 
 
481 aa  692    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  64.67 
 
 
481 aa  652    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  100 
 
 
482 aa  999    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  68.32 
 
 
483 aa  666    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  63.75 
 
 
481 aa  652    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  65 
 
 
485 aa  673    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  64.18 
 
 
600 aa  665    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  64.88 
 
 
481 aa  658    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  65.29 
 
 
481 aa  657    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  61.2 
 
 
473 aa  620  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  59.13 
 
 
597 aa  610  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  59.13 
 
 
600 aa  610  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  59.88 
 
 
597 aa  608  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  59.46 
 
 
597 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  56.31 
 
 
477 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  56.31 
 
 
494 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  56.67 
 
 
474 aa  560  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  40.64 
 
 
450 aa  317  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  41.7 
 
 
454 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  40.13 
 
 
399 aa  283  6.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  27.94 
 
 
374 aa  120  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  27.21 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  27.7 
 
 
374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  27.7 
 
 
374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  25.35 
 
 
374 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  25.35 
 
 
374 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  25.35 
 
 
374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  26.9 
 
 
366 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  25.75 
 
 
374 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  25.17 
 
 
374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  30 
 
 
377 aa  107  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  28.64 
 
 
439 aa  105  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  25.85 
 
 
371 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  31.87 
 
 
1022 aa  100  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  25.51 
 
 
376 aa  90.5  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  26.82 
 
 
915 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2062  hypothetical protein  24.73 
 
 
545 aa  58.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4788  hypothetical protein  24.83 
 
 
514 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.927804  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  25 
 
 
486 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  25.76 
 
 
434 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3457  hypothetical protein  21.39 
 
 
618 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3734  Arylsulfotransferase  25.93 
 
 
628 aa  47  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02186  conserved hypothetical protein  24.14 
 
 
572 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0354311  normal  0.214267 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1599  Arylsulfotransferase  23.05 
 
 
562 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3530  hypothetical protein  27.14 
 
 
450 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0171  Arylsulfotransferase  23.66 
 
 
626 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1927  hypothetical protein  23.97 
 
 
422 aa  44.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1509  arylsulfotransferase  21.77 
 
 
584 aa  44.3  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.407507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>