65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0607 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  69.04 
 
 
597 aa  711    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  69.04 
 
 
597 aa  704    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  70.59 
 
 
483 aa  707    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  70.5 
 
 
600 aa  726    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  70.48 
 
 
481 aa  715    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  79 
 
 
481 aa  815    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  100 
 
 
481 aa  994    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  75.88 
 
 
485 aa  791    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  68.46 
 
 
600 aa  712    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  67.5 
 
 
482 aa  692    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  68.64 
 
 
473 aa  681    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  69.25 
 
 
597 aa  698    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  70.12 
 
 
481 aa  712    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  70.75 
 
 
481 aa  719    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  61.59 
 
 
477 aa  620  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  62.68 
 
 
494 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  60.13 
 
 
474 aa  596  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  40.04 
 
 
450 aa  312  6.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  41.2 
 
 
454 aa  295  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  40.73 
 
 
399 aa  292  7e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  28.92 
 
 
374 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  28.92 
 
 
374 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  29.34 
 
 
374 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  29.3 
 
 
374 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  28.19 
 
 
374 aa  123  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  29.07 
 
 
374 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  29.07 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  29.07 
 
 
374 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  29.1 
 
 
371 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  28.9 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  27.7 
 
 
366 aa  117  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  27.99 
 
 
439 aa  108  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  28.01 
 
 
376 aa  107  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  30.18 
 
 
377 aa  103  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  31.02 
 
 
1022 aa  90.9  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  27.33 
 
 
915 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  25.28 
 
 
434 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  25.69 
 
 
486 aa  64.3  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02186  conserved hypothetical protein  28.94 
 
 
572 aa  57  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0354311  normal  0.214267 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2062  hypothetical protein  22.88 
 
 
545 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3457  hypothetical protein  24.72 
 
 
618 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4788  hypothetical protein  24.47 
 
 
514 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.927804  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1752  arylsulfotransferase  24.17 
 
 
586 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00146407  hitchhiker  0.00673142 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0171  Arylsulfotransferase  23.76 
 
 
626 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04257  conserved hypothetical protein  23.63 
 
 
632 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.491798 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0037  arylsulfotransferase  23.53 
 
 
572 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1756  hypothetical protein  24.03 
 
 
614 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0035  arylsulfotransferase  23.53 
 
 
572 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0785305 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05465  conserved hypothetical protein  27.86 
 
 
690 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548689  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0036  arylsulfotransferase  23.08 
 
 
572 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.453558  normal  0.16743 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0036  arylsulfotransferase  23.08 
 
 
572 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.719743  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1509  arylsulfotransferase  21.56 
 
 
584 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.407507 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0407  hypothetical protein  21.43 
 
 
447 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.342739 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3450  arylsulfate sulfotransferase  26.88 
 
 
598 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.921011 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1599  Arylsulfotransferase  24.41 
 
 
562 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3734  Arylsulfotransferase  23.24 
 
 
628 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3443  arylsulfate sulfotransferase  26.88 
 
 
598 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30935  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3378  arylsulfate sulfotransferase  26.88 
 
 
598 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.953621 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3373  arylsulfate sulfotransferase  26.88 
 
 
598 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3545  arylsulfate sulfotransferase  26.88 
 
 
598 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.949086 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4027  arylsulfotransferase  23.72 
 
 
586 aa  44.3  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3530  hypothetical protein  25.12 
 
 
450 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0777  hypothetical protein  40.68 
 
 
310 aa  43.9  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0901  fructose-bisphosphate aldolase  27.06 
 
 
588 aa  43.5  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1927  hypothetical protein  24.64 
 
 
422 aa  43.5  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>