46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0411 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  917    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  62.56 
 
 		 450 aa  558  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  58.75 
 
 		 399 aa  488  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  41.7 
 
 		 482 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  39.74 
 
 		 600 aa  303  5.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  39.53 
 
 		 597 aa  298  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  40 
 
 		 473 aa  297  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  41.2 
 
 		 481 aa  295  9e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  39.96 
 
 		 597 aa  294  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  39.79 
 
 		 600 aa  294  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  40.98 
 
 		 481 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  42.35 
 
 		 481 aa  293  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  39.57 
 
 		 597 aa  289  7e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  40.89 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  40.44 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  40.49 
 
 		 485 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  37.42 
 
 		 494 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  39.82 
 
 		 474 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  38.09 
 
 		 483 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  37.1 
 
 		 477 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  30.31 
 
 		 439 aa  124  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  29.82 
 
 		 374 aa  117  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  29.4 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  29.65 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  29.65 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  28.83 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  27.96 
 
 		 374 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  27.89 
 
 		 374 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  27.97 
 
 		 376 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  27.89 
 
 		 374 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  27.89 
 
 		 374 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  27.78 
 
 		 374 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  27.15 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1022 aa  94.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  27.34 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  23.67 
 
 		 434 aa  86.7  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  28.03 
 
 		 915 aa  82  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  27.2 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0407  hypothetical protein  24.38 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.342739 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10116  conserved hypothetical protein  25.69 
 
 		 587 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.195522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4788  hypothetical protein  25.37 
 
 		 514 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.927804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3457  hypothetical protein  23.55 
 
 		 618 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0777  hypothetical protein  31.3 
 
 		 310 aa  50.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1756  hypothetical protein  27.6 
 
 		 614 aa  47.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4647  hypothetical protein  26.61 
 
 		 397 aa  47  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05465  conserved hypothetical protein  25.49 
 
 		 690 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548689  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>