53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_08220 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  810    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  62.63 
 
 
450 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  58.75 
 
 
454 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  40.73 
 
 
481 aa  292  6e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  40.77 
 
 
597 aa  292  9e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  39.86 
 
 
600 aa  286  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  40.23 
 
 
597 aa  286  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  39.77 
 
 
597 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  40.5 
 
 
481 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  40.13 
 
 
482 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  39.82 
 
 
481 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  39.36 
 
 
481 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  37.76 
 
 
600 aa  281  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  40.09 
 
 
473 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  39.91 
 
 
485 aa  279  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  39.13 
 
 
481 aa  279  6e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  40.87 
 
 
483 aa  275  9e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  37.1 
 
 
494 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  37.3 
 
 
474 aa  259  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  36.3 
 
 
477 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  31.95 
 
 
374 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  32.21 
 
 
374 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  32.21 
 
 
374 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  32.21 
 
 
374 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  31.95 
 
 
374 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  30.05 
 
 
371 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  30.05 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  30.05 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  29.79 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  29.02 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  30.05 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  28.1 
 
 
377 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  28.97 
 
 
439 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  27.94 
 
 
1022 aa  98.6  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  26.88 
 
 
366 aa  97.4  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  26.59 
 
 
434 aa  73.2  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  26.02 
 
 
915 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4788  hypothetical protein  25.61 
 
 
514 aa  67  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.927804  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  24.28 
 
 
486 aa  53.9  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1756  hypothetical protein  25.76 
 
 
614 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3457  hypothetical protein  24.14 
 
 
618 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0407  hypothetical protein  24.19 
 
 
447 aa  50.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.342739 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2404  Arylsulfotransferase  25.7 
 
 
1349 aa  50.1  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3106  hypothetical protein  38.55 
 
 
351 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000218303  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1462  Arylsulfotransferase  23.47 
 
 
524 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10116  conserved hypothetical protein  23.99 
 
 
587 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.195522  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3545  arylsulfate sulfotransferase  23.61 
 
 
598 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.949086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3373  arylsulfate sulfotransferase  23.61 
 
 
598 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3378  arylsulfate sulfotransferase  23.61 
 
 
598 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.953621 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3450  arylsulfate sulfotransferase  23.61 
 
 
598 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.921011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3443  arylsulfate sulfotransferase  23.61 
 
 
598 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30935  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0777  hypothetical protein  42.86 
 
 
310 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2062  hypothetical protein  21.45 
 
 
545 aa  42.7  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>