65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2626 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  68.62 
 
 
481 aa  697    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  68.05 
 
 
481 aa  699    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  67.36 
 
 
481 aa  702    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  67.78 
 
 
481 aa  696    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  69.04 
 
 
481 aa  711    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  64.76 
 
 
600 aa  834    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  65.9 
 
 
485 aa  682    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  83.45 
 
 
597 aa  1046    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  85.55 
 
 
600 aa  1075    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  100 
 
 
597 aa  1230    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  82.94 
 
 
597 aa  1038    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  62.68 
 
 
483 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  60.17 
 
 
473 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  59.13 
 
 
482 aa  610  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  61.12 
 
 
477 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  60.25 
 
 
494 aa  595  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  59.24 
 
 
474 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  40.08 
 
 
450 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  40.77 
 
 
399 aa  292  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  39.57 
 
 
454 aa  288  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  28.36 
 
 
374 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  28.61 
 
 
371 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  28.36 
 
 
374 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  28.36 
 
 
374 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  27.38 
 
 
374 aa  111  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  28.36 
 
 
374 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  28.32 
 
 
374 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  27.05 
 
 
366 aa  107  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  26.89 
 
 
374 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  26.89 
 
 
374 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  27.38 
 
 
374 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  30.66 
 
 
377 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  26.14 
 
 
376 aa  96.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  26.87 
 
 
439 aa  94  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  26.35 
 
 
1022 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  26.05 
 
 
915 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  24.22 
 
 
434 aa  62.4  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2062  hypothetical protein  25.82 
 
 
545 aa  62.4  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4788  hypothetical protein  27.64 
 
 
514 aa  60.1  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.927804  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  24.91 
 
 
486 aa  59.3  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02186  conserved hypothetical protein  29 
 
 
572 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0354311  normal  0.214267 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  37.63 
 
 
301 aa  53.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10788  predicted protein  35.16 
 
 
117 aa  51.2  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3734  Arylsulfotransferase  22.97 
 
 
628 aa  51.2  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04257  conserved hypothetical protein  23.53 
 
 
632 aa  50.8  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.491798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  40 
 
 
298 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3457  hypothetical protein  24.21 
 
 
618 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  39.51 
 
 
303 aa  49.3  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  41.1 
 
 
286 aa  48.1  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0171  Arylsulfotransferase  25 
 
 
626 aa  47.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  40 
 
 
111 aa  47.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  35.9 
 
 
107 aa  47.4  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  35.9 
 
 
107 aa  47.4  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1599  Arylsulfotransferase  24.74 
 
 
562 aa  47.4  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1756  hypothetical protein  24.07 
 
 
614 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  35 
 
 
421 aa  45.4  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  35 
 
 
109 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  35 
 
 
109 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  35 
 
 
109 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  34.62 
 
 
107 aa  44.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  37.5 
 
 
109 aa  44.3  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0054  thioredoxin, putative  38.78 
 
 
142 aa  44.3  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  35.71 
 
 
102 aa  44.3  0.007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2277  Thioredoxin domain protein  28.57 
 
 
149 aa  43.9  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00669131  hitchhiker  0.000000625569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  35.8 
 
 
144 aa  43.5  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>