82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1351 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  64.77 
 
 		 600 aa  842    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  67.99 
 
 		 481 aa  707    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  68.46 
 
 		 481 aa  712    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  66.95 
 
 		 485 aa  687    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  68.4 
 
 		 481 aa  692    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 600 aa  1234    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  85.55 
 
 		 597 aa  1075    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  67.98 
 
 		 481 aa  692    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  83.14 
 
 		 597 aa  1055    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  68.05 
 
 		 481 aa  694    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  81.83 
 
 		 597 aa  1043    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  63.1 
 
 		 483 aa  628  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  59.13 
 
 		 482 aa  610  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  59.87 
 
 		 473 aa  609  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  60.29 
 
 		 477 aa  593  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  59.83 
 
 		 494 aa  590  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  58.95 
 
 		 474 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  40.6 
 
 		 450 aa  311  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  39.79 
 
 		 454 aa  293  6e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  39.86 
 
 		 399 aa  286  7e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  28.36 
 
 		 374 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  29.16 
 
 		 371 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  28.12 
 
 		 374 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  28.12 
 
 		 374 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  28.4 
 
 		 374 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  27.05 
 
 		 366 aa  109  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  28.43 
 
 		 374 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  32.12 
 
 		 377 aa  107  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  28.19 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  28.26 
 
 		 374 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  28.19 
 
 		 374 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  28.39 
 
 		 374 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  25.91 
 
 		 376 aa  98.2  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  26.79 
 
 		 439 aa  93.6  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1022 aa  84  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  25.94 
 
 		 915 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  25 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2062  hypothetical protein  23.43 
 
 		 545 aa  56.6  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  23.91 
 
 		 486 aa  56.6  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4788  hypothetical protein  25.45 
 
 		 514 aa  55.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.927804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  38.37 
 
 		 259 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  38.75 
 
 		 146 aa  51.6  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04257  conserved hypothetical protein  23.6 
 
 		 632 aa  50.8  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.491798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  38.46 
 
 		 259 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  35.59 
 
 		 286 aa  49.3  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4209  thioredoxin  41.67 
 
 		 151 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3734  Arylsulfotransferase  23.22 
 
 		 628 aa  49.7  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  38.78 
 
 		 145 aa  48.5  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  38.78 
 
 		 145 aa  48.5  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02186  conserved hypothetical protein  26.25 
 
 		 572 aa  48.5  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0354311  normal  0.214267 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  35.8 
 
 		 144 aa  48.5  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  35.8 
 
 		 144 aa  48.5  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  35.16 
 
 		 303 aa  48.5  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45140  thioredoxin 2, TxrC  37.5 
 
 		 144 aa  47.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  35.71 
 
 		 146 aa  48.1  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  37.8 
 
 		 287 aa  47.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  33.72 
 
 		 150 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  34.94 
 
 		 144 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  33.72 
 
 		 150 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  33.72 
 
 		 150 aa  47.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  40.62 
 
 		 145 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  31.58 
 
 		 98 aa  47  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  31.68 
 
 		 144 aa  45.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 298 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3032  hypothetical protein  37.8 
 
 		 155 aa  46.2  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  33.71 
 
 		 257 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  35 
 
 		 145 aa  45.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  32.04 
 
 		 421 aa  45.4  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0171  Arylsulfotransferase  23.5 
 
 		 626 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  33.33 
 
 		 144 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  33.02 
 
 		 301 aa  44.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  35.53 
 
 		 285 aa  44.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  29.51 
 
 		 287 aa  44.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  32.5 
 
 		 107 aa  44.3  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3457  hypothetical protein  22.37 
 
 		 618 aa  44.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  32.5 
 
 		 107 aa  44.3  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  34.12 
 
 		 144 aa  44.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  32.5 
 
 		 107 aa  44.3  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  35.53 
 
 		 150 aa  44.3  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  31.52 
 
 		 106 aa  43.9  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  29.79 
 
 		 289 aa  43.5  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  36.96 
 
 		 145 aa  43.5  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>