50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4012 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  773    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  98.66 
 
 		 374 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  98.93 
 
 		 374 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  98.66 
 
 		 374 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  98.93 
 
 		 374 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  57.57 
 
 		 371 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  59.78 
 
 		 376 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  57.14 
 
 		 374 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  56.87 
 
 		 374 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  56.87 
 
 		 374 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  56.33 
 
 		 374 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  44.69 
 
 		 377 aa  317  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  42.11 
 
 		 366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  32.21 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  29.3 
 
 		 481 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  26.81 
 
 		 481 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  27.38 
 
 		 481 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  27.92 
 
 		 600 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  27.19 
 
 		 481 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  27.42 
 
 		 473 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  25.93 
 
 		 481 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  28.34 
 
 		 597 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  29.37 
 
 		 597 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  27.34 
 
 		 485 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  25.75 
 
 		 482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  29.04 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  28.36 
 
 		 597 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  29.8 
 
 		 439 aa  109  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  27.96 
 
 		 454 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  28.43 
 
 		 600 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  27.08 
 
 		 474 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1022 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  26.28 
 
 		 483 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  27.38 
 
 		 494 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  25.91 
 
 		 477 aa  96.7  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  25.41 
 
 		 915 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3457  hypothetical protein  27.92 
 
 		 618 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1599  Arylsulfotransferase  24.72 
 
 		 562 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  30.81 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4788  hypothetical protein  25.94 
 
 		 514 aa  76.3  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.927804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0407  hypothetical protein  27.51 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.342739 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  27.92 
 
 		 486 aa  66.6  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2062  hypothetical protein  26.03 
 
 		 545 aa  55.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1756  hypothetical protein  24.76 
 
 		 614 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3530  hypothetical protein  31.44 
 
 		 450 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02186  conserved hypothetical protein  26.26 
 
 		 572 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0354311  normal  0.214267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3106  hypothetical protein  30.63 
 
 		 351 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000218303  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05465  conserved hypothetical protein  33.73 
 
 		 690 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548689  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10116  conserved hypothetical protein  26.54 
 
 		 587 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.195522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1349  hypothetical protein  21.1 
 
 		 488 aa  43.1  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>