49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3830 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  98.93 
 
 
374 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  99.2 
 
 
374 aa  767    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  100 
 
 
374 aa  774    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  99.2 
 
 
374 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  98.93 
 
 
374 aa  765    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  57.84 
 
 
371 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  60.33 
 
 
376 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  57.41 
 
 
374 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  57.14 
 
 
374 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  57.14 
 
 
374 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  56.6 
 
 
374 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  44.96 
 
 
377 aa  318  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  42.38 
 
 
366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  31.95 
 
 
399 aa  122  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  28.9 
 
 
481 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  26.4 
 
 
481 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  26.22 
 
 
481 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  26.74 
 
 
481 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  27.25 
 
 
473 aa  113  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  27.52 
 
 
600 aa  112  8.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  25.52 
 
 
481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  28.95 
 
 
597 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  27.94 
 
 
597 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  29.57 
 
 
439 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  25.17 
 
 
482 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  28.75 
 
 
450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  26.92 
 
 
485 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  28.32 
 
 
597 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  27.78 
 
 
454 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  28.39 
 
 
600 aa  103  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  28.33 
 
 
1022 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  26.68 
 
 
474 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  25.52 
 
 
483 aa  96.7  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  26.96 
 
 
494 aa  95.9  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  25.49 
 
 
477 aa  92.8  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3457  hypothetical protein  27.5 
 
 
618 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1599  Arylsulfotransferase  25.22 
 
 
562 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  30.81 
 
 
434 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  25.14 
 
 
915 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4788  hypothetical protein  26.12 
 
 
514 aa  76.6  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.927804  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0407  hypothetical protein  27.51 
 
 
447 aa  70.1  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.342739 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  31.05 
 
 
486 aa  65.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2062  hypothetical protein  26.03 
 
 
545 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1756  hypothetical protein  24.76 
 
 
614 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3530  hypothetical protein  31.44 
 
 
450 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3106  hypothetical protein  30.63 
 
 
351 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000218303  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02186  conserved hypothetical protein  25.93 
 
 
572 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0354311  normal  0.214267 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05465  conserved hypothetical protein  35.23 
 
 
690 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548689  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10116  conserved hypothetical protein  26.54 
 
 
587 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.195522  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>