More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0484 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  64.76 
 
 		 597 aa  834    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  69.77 
 
 		 481 aa  718    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 600 aa  1234    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  66.95 
 
 		 485 aa  708    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  64.63 
 
 		 483 aa  644    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  65.77 
 
 		 597 aa  834    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  70.54 
 
 		 481 aa  723    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  64.92 
 
 		 597 aa  833    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  66.95 
 
 		 481 aa  707    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  70.5 
 
 		 481 aa  726    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  64.18 
 
 		 482 aa  665    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  64.77 
 
 		 600 aa  842    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  69.73 
 
 		 481 aa  713    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  62.26 
 
 		 473 aa  626  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  60.08 
 
 		 494 aa  599  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  59.08 
 
 		 477 aa  599  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  58.02 
 
 		 474 aa  579  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  39.62 
 
 		 450 aa  317  6e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  39.74 
 
 		 454 aa  302  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  37.76 
 
 		 399 aa  281  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  27.92 
 
 		 374 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  25.97 
 
 		 374 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  25.97 
 
 		 374 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  25.97 
 
 		 374 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  26.85 
 
 		 366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  27.52 
 
 		 374 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  30.17 
 
 		 439 aa  107  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  23.67 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  24.43 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  23.84 
 
 		 374 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  24.82 
 
 		 374 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  23.84 
 
 		 374 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  30.29 
 
 		 377 aa  104  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  23.86 
 
 		 376 aa  95.9  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1022 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  32.73 
 
 		 108 aa  67.8  0.0000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  40.62 
 
 		 112 aa  67  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  25.62 
 
 		 915 aa  67  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  40.22 
 
 		 105 aa  66.2  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  37.78 
 
 		 98 aa  65.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  36.78 
 
 		 108 aa  64.3  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  35.63 
 
 		 108 aa  64.3  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  39.08 
 
 		 108 aa  63.9  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  34.83 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  36.47 
 
 		 108 aa  63.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  35.63 
 
 		 108 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  35.63 
 
 		 108 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  37.93 
 
 		 108 aa  62.4  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  35.63 
 
 		 108 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  35.63 
 
 		 108 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  35.63 
 
 		 146 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3933  thioredoxin  32.93 
 
 		 107 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  40.96 
 
 		 108 aa  62.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  35.63 
 
 		 108 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  34.48 
 
 		 110 aa  62.4  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  35.63 
 
 		 108 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  40.24 
 
 		 109 aa  62  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  40.24 
 
 		 109 aa  62  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  40.24 
 
 		 109 aa  62  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  40.24 
 
 		 109 aa  62  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  35.63 
 
 		 108 aa  62  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  40.24 
 
 		 109 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  40.24 
 
 		 109 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  40.24 
 
 		 109 aa  62  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  40.24 
 
 		 109 aa  62  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  40.24 
 
 		 109 aa  62  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  36.78 
 
 		 108 aa  62  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  35.63 
 
 		 146 aa  62  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5011  thioredoxin  32.93 
 
 		 107 aa  62  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  40.24 
 
 		 109 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  40.24 
 
 		 109 aa  62  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  40.24 
 
 		 109 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  36.78 
 
 		 108 aa  62  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  40.24 
 
 		 109 aa  62  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  40.24 
 
 		 109 aa  62  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  40.24 
 
 		 109 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  36.78 
 
 		 108 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  36.78 
 
 		 108 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  36.78 
 
 		 108 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  34.48 
 
 		 108 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  36.78 
 
 		 108 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  34.48 
 
 		 108 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  38.1 
 
 		 108 aa  61.6  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  36.78 
 
 		 108 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  36.78 
 
 		 108 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  36.78 
 
 		 108 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  33.72 
 
 		 108 aa  61.2  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  35.63 
 
 		 108 aa  61.2  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  37.8 
 
 		 110 aa  61.2  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  34.48 
 
 		 108 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  34.48 
 
 		 109 aa  61.2  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  37.8 
 
 		 110 aa  61.2  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  37.8 
 
 		 110 aa  61.2  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  35.63 
 
 		 108 aa  61.2  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  33.33 
 
 		 133 aa  61.2  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  35.63 
 
 		 108 aa  61.2  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  36.78 
 
 		 108 aa  60.8  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  39.29 
 
 		 108 aa  60.8  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  34.48 
 
 		 110 aa  60.8  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  34.48 
 
 		 110 aa  60.5  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>