52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0236 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_08230  Arylsulfotransferase  73.5 
 
 
590 aa  846    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5000  arylsulfotransferase  94.44 
 
 
558 aa  1082    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164429  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0236  arylsulfotransferase  100 
 
 
558 aa  1134    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1149  arylsulfotransferase  47.63 
 
 
606 aa  522  1e-147  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4430  arylsulfotransferase  48.32 
 
 
596 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4498  arylsulfotransferase  48.5 
 
 
596 aa  515  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0436  arylsulfotransferase  49.38 
 
 
602 aa  513  1e-144  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4314  arylsulfotransferase  48.5 
 
 
596 aa  515  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4429  arylsulfotransferase  48.5 
 
 
565 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4344  arylsulfotransferase  48.5 
 
 
596 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0844  arylsulfotransferase  45.63 
 
 
590 aa  481  1e-134  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4188  arylsulfotransferase  43.82 
 
 
607 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4260  arylsulfotransferase  43.65 
 
 
607 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.790155  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4211  arylsulfotransferase  43.99 
 
 
607 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4307  arylsulfotransferase  43.65 
 
 
607 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4367  arylsulfotransferase  43.82 
 
 
607 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4027  arylsulfotransferase  46.36 
 
 
586 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0901  fructose-bisphosphate aldolase  43.92 
 
 
588 aa  457  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0237  arylsulfate sulfotransferase  46.88 
 
 
567 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1752  arylsulfotransferase  46.36 
 
 
586 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00146407  hitchhiker  0.00673142 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3443  arylsulfate sulfotransferase  44.52 
 
 
598 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30935  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3378  arylsulfate sulfotransferase  44.52 
 
 
598 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.953621 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3450  arylsulfate sulfotransferase  44.52 
 
 
598 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.921011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3373  arylsulfate sulfotransferase  44.52 
 
 
598 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3545  arylsulfate sulfotransferase  44.52 
 
 
598 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.949086 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0231  arylsulfotransferase  42.69 
 
 
611 aa  442  1e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3333  arylsulfate sulfotransferase  43.72 
 
 
598 aa  435  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0560  arylsulfate sulfotransferase  41.14 
 
 
616 aa  436  1e-121  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1382  arylsulfotransferase  41.98 
 
 
625 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.019077  normal  0.109845 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1436  Arylsulfotransferase  41.98 
 
 
625 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0759289 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4022  arylsulfotransferase  40.71 
 
 
596 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0882  arylsulfate sulfotransferase, degenerate  40.2 
 
 
620 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3872  arylsulfate sulfotransferase  41.64 
 
 
596 aa  411  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4001  arylsulfate sulfotransferase  40.9 
 
 
591 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0413696 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1584  arylsulfotransferase  41.31 
 
 
601 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2404  Arylsulfotransferase  29.42 
 
 
1349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0171  Arylsulfotransferase  26.97 
 
 
626 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3734  Arylsulfotransferase  39.13 
 
 
628 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0036  arylsulfotransferase  24.74 
 
 
572 aa  80.9  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.719743  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0036  arylsulfotransferase  24.83 
 
 
572 aa  80.5  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.453558  normal  0.16743 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0035  arylsulfotransferase  24.48 
 
 
572 aa  80.1  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0785305 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0037  arylsulfotransferase  24.48 
 
 
572 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0042  arylsulfotransferase  24.71 
 
 
571 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.176316 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0041  arylsulfotransferase  24.66 
 
 
571 aa  75.1  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089989 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  27.88 
 
 
915 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0043  arylsulfotransferase  24.47 
 
 
571 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24720  hypothetical protein  61.02 
 
 
109 aa  75.1  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0043  arylsulfotransferase  24.71 
 
 
571 aa  74.3  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1825  Arylsulfotransferase  28.7 
 
 
502 aa  61.2  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.56957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1509  arylsulfotransferase  22.22 
 
 
584 aa  59.3  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.407507 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1462  Arylsulfotransferase  23.65 
 
 
524 aa  56.6  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1756  hypothetical protein  31.82 
 
 
614 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>