14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2378 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2378  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  831    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3560  hypothetical protein  37.35 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3934  hypothetical protein  29.92 
 
 		 325 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0625506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4251  hypothetical protein  40.71 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  hitchhiker  0.0000638006 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1880  PEBP family protein  31.65 
 
 		 663 aa  89.7  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5144  hypothetical protein  32.51 
 
 		 267 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2606  hypothetical protein  35.54 
 
 		 338 aa  86.3  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000022534  hitchhiker  0.002522 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1526  hypothetical protein  33.57 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2907  hypothetical protein  30.88 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0324475  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1820  hypothetical protein  30.81 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.210481  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0783  hypothetical protein  30.43 
 
 		 528 aa  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.07808  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0236  hypothetical protein  30.91 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  23.94 
 
 		 915 aa  58.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1777  hypothetical protein  23.73 
 
 		 339 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.368036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>