10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1820 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1820  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  906    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.210481  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1526  hypothetical protein  33.44 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2907  hypothetical protein  29.57 
 
 		 359 aa  110  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0324475  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2378  hypothetical protein  30.81 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1880  PEBP family protein  32.7 
 
 		 663 aa  63.2  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5144  hypothetical protein  29.88 
 
 		 267 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4251  hypothetical protein  26.89 
 
 		 374 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  hitchhiker  0.0000638006 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0236  hypothetical protein  27.46 
 
 		 336 aa  50.1  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1777  hypothetical protein  27.7 
 
 		 339 aa  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.368036  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2606  hypothetical protein  27.91 
 
 		 338 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000022534  hitchhiker  0.002522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>