10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0236 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0236  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  688    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1777  hypothetical protein  54.84 
 
 		 339 aa  281  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.368036  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4251  hypothetical protein  48.75 
 
 		 374 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  hitchhiker  0.0000638006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3560  hypothetical protein  43.09 
 
 		 323 aa  185  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3934  hypothetical protein  41.63 
 
 		 325 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0625506 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2378  hypothetical protein  30.91 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  29.32 
 
 		 915 aa  53.5  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1820  hypothetical protein  27.46 
 
 		 438 aa  50.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.210481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5144  hypothetical protein  25.23 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2606  hypothetical protein  24.73 
 
 		 338 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000022534  hitchhiker  0.002522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>