10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3560 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3560  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  644    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3934  hypothetical protein  83.69 
 
 		 325 aa  518  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0625506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4251  hypothetical protein  43.93 
 
 		 374 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  hitchhiker  0.0000638006 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0236  hypothetical protein  43.09 
 
 		 336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1777  hypothetical protein  39.72 
 
 		 339 aa  182  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.368036  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2378  hypothetical protein  37.35 
 
 		 398 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1116  hypothetical protein  27.05 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000122639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5144  hypothetical protein  26.22 
 
 		 267 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2907  hypothetical protein  26.87 
 
 		 359 aa  46.2  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0324475  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1526  hypothetical protein  30.7 
 
 		 343 aa  42.7  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>