11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5144 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5144  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  545  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2378  hypothetical protein  32.51 
 
 
398 aa  90.1  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1880  PEBP family protein  34.5 
 
 
663 aa  89  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2606  hypothetical protein  36.97 
 
 
338 aa  82  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000022534  hitchhiker  0.002522 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4251  hypothetical protein  28.69 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  hitchhiker  0.0000638006 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1820  hypothetical protein  29.88 
 
 
438 aa  63.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.210481  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3934  hypothetical protein  24.24 
 
 
325 aa  52.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0625506 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1526  hypothetical protein  31.5 
 
 
343 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3560  hypothetical protein  25.37 
 
 
323 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1777  hypothetical protein  26.67 
 
 
339 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.368036  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0236  hypothetical protein  25.23 
 
 
336 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>