155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1880 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1880  PEBP family protein  100 
 
 		 663 aa  1368    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2378  hypothetical protein  31.65 
 
 		 398 aa  89.7  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5144  hypothetical protein  34.5 
 
 		 267 aa  87  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0606  PEBP family protein  29.35 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.839028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0634  PEBP family protein  29.35 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.731685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  33.33 
 
 		 184 aa  78.2  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  35.54 
 
 		 194 aa  75.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  32.93 
 
 		 200 aa  75.5  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  31.45 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  33.77 
 
 		 176 aa  74.3  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  35.48 
 
 		 158 aa  73.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  37.11 
 
 		 179 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  32.74 
 
 		 181 aa  72.4  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  34.18 
 
 		 157 aa  72  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  34.25 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  32.67 
 
 		 176 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  33.33 
 
 		 156 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  32.12 
 
 		 206 aa  68.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1526  hypothetical protein  31.01 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0316  phosphatidylethanolamine-binding protein  32.91 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  33.54 
 
 		 159 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  33.54 
 
 		 159 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  33.54 
 
 		 159 aa  65.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7099  PEBP family protein  36.09 
 
 		 189 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  34.44 
 
 		 179 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  32.48 
 
 		 159 aa  64.7  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  34.06 
 
 		 179 aa  64.7  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  29.87 
 
 		 154 aa  64.3  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  34.06 
 
 		 179 aa  64.7  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2606  hypothetical protein  31.25 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000022534  hitchhiker  0.002522 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  33.11 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1820  hypothetical protein  32.7 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.210481  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1246  PEBP family protein  33.33 
 
 		 175 aa  63.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  29.24 
 
 		 194 aa  62.4  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4884  hypothetical protein  35.57 
 
 		 186 aa  61.6  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0280  PBP family phospholipid-binding protein  32.19 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  33.11 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  30.87 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  29.41 
 
 		 175 aa  60.1  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  32.88 
 
 		 182 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  30.77 
 
 		 185 aa  60.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  29.56 
 
 		 157 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  35.97 
 
 		 184 aa  60.1  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8369  PEBP family protein  33.1 
 
 		 199 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632838  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  29.41 
 
 		 175 aa  59.7  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  35.25 
 
 		 190 aa  59.7  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6791  Phospholipid-binding protein-like protein  31.58 
 
 		 188 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.441972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  32.77 
 
 		 181 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0357  Phospholipid-binding protein  33.58 
 
 		 165 aa  58.9  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.89255 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  32.9 
 
 		 156 aa  58.2  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  32.12 
 
 		 179 aa  58.5  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1700  PEBP family protein  31.36 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  28.21 
 
 		 155 aa  58.2  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  29.8 
 
 		 149 aa  57.8  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  29.03 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  32.78 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  32.03 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  29.41 
 
 		 155 aa  57.8  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0279  PBP family phospholipid-binding protein  34.88 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181285 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1789  PBP family phospholipid-binding protein  40.86 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  34.78 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  30.67 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3733  PBP family phospholipid-binding protein  31.1 
 
 		 184 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  29.49 
 
 		 191 aa  57  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1992  PEBP family protein  30.07 
 
 		 180 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  28.93 
 
 		 157 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  31.39 
 
 		 192 aa  56.2  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  28.1 
 
 		 150 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  28.1 
 
 		 150 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  30.67 
 
 		 149 aa  55.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06342  hypothetical protein  34.78 
 
 		 177 aa  55.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3134  PEBP family protein  32.03 
 
 		 206 aa  55.1  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  30.38 
 
 		 188 aa  54.7  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  30.4 
 
 		 158 aa  54.7  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0182  PBP family phospholipid-binding protein  28.39 
 
 		 186 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0985  PEBP family protein  32.75 
 
 		 189 aa  54.7  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340221  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2899  PEBP family protein  32.5 
 
 		 218 aa  53.9  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.970699  normal  0.309684 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  32.26 
 
 		 157 aa  53.9  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  30 
 
 		 153 aa  53.9  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0780  PEBP family protein  50 
 
 		 162 aa  53.9  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  29.17 
 
 		 153 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0871  PEBP family protein  35.24 
 
 		 177 aa  53.5  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.393701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2785  PEBP family protein  29.11 
 
 		 183 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252116  normal  0.340055 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3047  hypothetical protein  34.01 
 
 		 185 aa  53.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2035  putative kinase inhibitor  29.07 
 
 		 183 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  28.49 
 
 		 183 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3081  PEBP family protein  28.48 
 
 		 158 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  28.49 
 
 		 183 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  30.07 
 
 		 149 aa  52  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4251  hypothetical protein  26.14 
 
 		 374 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  hitchhiker  0.0000638006 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  33.08 
 
 		 207 aa  51.6  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2643  PEBP family protein  28.48 
 
 		 183 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1917  PEBP family protein  30.47 
 
 		 174 aa  51.6  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.184289 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001407  phospholipid-binding protein  31.3 
 
 		 177 aa  51.2  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  30.82 
 
 		 190 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  28.48 
 
 		 181 aa  51.2  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1597  PEBP family protein  31.53 
 
 		 183 aa  50.8  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3163  PBP family phospholipid-binding protein  29.24 
 
 		 178 aa  50.8  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.650541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3225  PBP family phospholipid-binding protein  29.24 
 
 		 178 aa  50.8  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3175  PBP family phospholipid-binding protein  29.24 
 
 		 178 aa  50.8  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>