264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2785 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2785  PEBP family protein  100 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252116  normal  0.340055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2643  PEBP family protein  88.52 
 
 		 183 aa  320  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2489  PEBP family protein  80.33 
 
 		 183 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.182632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3081  PEBP family protein  91.77 
 
 		 158 aa  298  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3733  PBP family phospholipid-binding protein  45.36 
 
 		 184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2903  PEBP family protein  46.3 
 
 		 188 aa  135  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  39.89 
 
 		 187 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  39.89 
 
 		 187 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7099  PEBP family protein  42.58 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0182  PBP family phospholipid-binding protein  37.22 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333114  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  36.26 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  45.8 
 
 		 617 aa  96.3  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  40.62 
 
 		 158 aa  94.4  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  35.26 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0280  PBP family phospholipid-binding protein  32.97 
 
 		 182 aa  91.3  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  32.97 
 
 		 182 aa  90.9  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  36.46 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  30.73 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  36.07 
 
 		 176 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  33.51 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  35.75 
 
 		 200 aa  89  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  37.65 
 
 		 191 aa  88.2  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  28.88 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  39.55 
 
 		 182 aa  88.2  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0316  phosphatidylethanolamine-binding protein  36.25 
 
 		 159 aa  87.4  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  35.23 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  36.42 
 
 		 156 aa  86.7  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  38.81 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  38.52 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2615  YbhB and YbcL  34.73 
 
 		 247 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1447  PEBP family protein  32.02 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  38.52 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  38.52 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  32.26 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  28.33 
 
 		 181 aa  85.5  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  34.16 
 
 		 179 aa  85.5  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  34.66 
 
 		 176 aa  85.5  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  34.16 
 
 		 179 aa  85.5  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  34.16 
 
 		 179 aa  85.1  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  34.16 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  37.27 
 
 		 156 aa  84.3  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1246  PEBP family protein  32.95 
 
 		 175 aa  84.3  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2718  PEBP family protein  36.25 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3962  YbcL  32.6 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815606  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  37.57 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3163  PBP family phospholipid-binding protein  33.33 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.650541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3225  PBP family phospholipid-binding protein  33.33 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3175  PBP family phospholipid-binding protein  33.33 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3038  PEBP family protein  32.92 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  34.16 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0671  PEBP family protein  30.25 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636068  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1597  PEBP family protein  32.85 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0693  PBP family phospholipid-binding protein  30.25 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0102847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4403  PEBP family protein  33.53 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  32.58 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  35.4 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  37.27 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  30.99 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  31.36 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0019  PEBP family protein  37.12 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  28.72 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  31.36 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  35.76 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8369  PEBP family protein  33.77 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0279  PBP family phospholipid-binding protein  42.19 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181285 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2434  PEBP family protein  32.3 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0392819  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3134  PEBP family protein  31.62 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  32.34 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2035  putative kinase inhibitor  31.36 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  36.36 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  37.21 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  34.16 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1700  PEBP family protein  31.28 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0594  hypothetical protein  30.68 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  35.19 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  32.48 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  31.93 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0871  PEBP family protein  35.88 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.393701 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  29.83 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5877  PEBP family protein  35.92 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12230  conserved hypothetical protein TIGR00481  34.78 
 
 		 161 aa  77.4  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.888512  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  32.95 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3288  PEBP family protein  33.12 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0439012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6437  PEBP family protein  35.71 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  37.98 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  32.39 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  36.3 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1992  PEBP family protein  39.18 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  32.04 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2774  PBP family phospholipid-binding protein  35.03 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.504548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3488  PEBP family protein  31.68 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274615  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38600  phospholipid-binding protein, PBP family  35.11 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  34.78 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0033  PBP family phospholipid-binding protein  34.35 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1917  PEBP family protein  32.34 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.184289 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  35.71 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  34.39 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0985  PEBP family protein  31.11 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340221  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  31.65 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12170  hypothetical protein  33.75 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.662377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>