264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2643 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2643  PEBP family protein  100 
 
 		 183 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2785  PEBP family protein  88.52 
 
 		 183 aa  332  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252116  normal  0.340055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3081  PEBP family protein  98.73 
 
 		 158 aa  316  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2489  PEBP family protein  80.87 
 
 		 183 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.182632 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3733  PBP family phospholipid-binding protein  50.96 
 
 		 184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  42.02 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  42.02 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2903  PEBP family protein  46.71 
 
 		 188 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7099  PEBP family protein  43.87 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0182  PBP family phospholipid-binding protein  37.99 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333114  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  39.77 
 
 		 179 aa  111  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  40 
 
 		 158 aa  97.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  40.96 
 
 		 617 aa  97.1  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  36.72 
 
 		 185 aa  95.5  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  40 
 
 		 182 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  29.95 
 
 		 184 aa  92.4  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  34.59 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  38.33 
 
 		 183 aa  91.3  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  39.31 
 
 		 182 aa  90.9  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  39.31 
 
 		 182 aa  91.3  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  34.59 
 
 		 182 aa  90.9  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  36.42 
 
 		 176 aa  90.9  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0280  PBP family phospholipid-binding protein  33.51 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  39.31 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  39.31 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  32.4 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  37.65 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  36.65 
 
 		 158 aa  89  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  30.39 
 
 		 181 aa  88.6  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  37.5 
 
 		 200 aa  88.2  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  35.23 
 
 		 184 aa  88.2  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1447  PEBP family protein  31.69 
 
 		 181 aa  87.8  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  36.48 
 
 		 193 aa  87.8  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  36.11 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  33.52 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  33.52 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  33.52 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  33.52 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0594  hypothetical protein  32.97 
 
 		 180 aa  85.5  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  36.65 
 
 		 156 aa  85.1  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  35.8 
 
 		 157 aa  84.7  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  37.89 
 
 		 155 aa  84.7  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0279  PBP family phospholipid-binding protein  37.5 
 
 		 200 aa  84.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0316  phosphatidylethanolamine-binding protein  34.38 
 
 		 159 aa  84  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1597  PEBP family protein  30.38 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  34.16 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  32.97 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  33.33 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8369  PEBP family protein  35.71 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  34.12 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  35.67 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  34.78 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2434  PEBP family protein  33.54 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0392819  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3962  YbcL  32.26 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815606  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  33.54 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  35.4 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6437  PEBP family protein  38.1 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2718  PEBP family protein  35.12 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3163  PBP family phospholipid-binding protein  33.33 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.650541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3225  PBP family phospholipid-binding protein  33.33 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3175  PBP family phospholipid-binding protein  33.33 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3038  PEBP family protein  33.54 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  37.82 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2615  YbhB and YbcL  37.98 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0019  PEBP family protein  37.88 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  35 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  30.72 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0871  PEBP family protein  36.09 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.393701 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  36.43 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  30 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1246  PEBP family protein  32.89 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  35.58 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1700  PEBP family protein  30.23 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  33.12 
 
 		 149 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3288  PEBP family protein  34.38 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0439012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  36.26 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  37.69 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1038  PEBP family protein  33.54 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0033  PBP family phospholipid-binding protein  36.64 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  34.76 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  35.44 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  37.82 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4302  PEBP family protein  31.13 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3837  YbhB and YbcL  31.21 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3134  PEBP family protein  30.88 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  34.38 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  32.08 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  32.08 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  31.48 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  36.36 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  33.54 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  32.69 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  37.5 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  36.31 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  37.5 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12230  conserved hypothetical protein TIGR00481  33.33 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.888512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4403  PEBP family protein  32.7 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  36.84 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  32.1 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  35 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>