265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0182 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0182  PBP family phospholipid-binding protein  100 
 
 
186 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333114  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7099  PEBP family protein  51.95 
 
 
189 aa  156  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  43.9 
 
 
187 aa  131  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  43.9 
 
 
187 aa  131  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3733  PBP family phospholipid-binding protein  44.3 
 
 
184 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2903  PEBP family protein  42.11 
 
 
188 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2489  PEBP family protein  38.33 
 
 
183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.182632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2785  PEBP family protein  37.22 
 
 
183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252116  normal  0.340055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2643  PEBP family protein  37.99 
 
 
183 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3081  PEBP family protein  45.45 
 
 
158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625763  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  37.22 
 
 
184 aa  111  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  35.39 
 
 
179 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  40 
 
 
200 aa  98.2  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1992  PEBP family protein  33.74 
 
 
180 aa  97.8  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0671  PEBP family protein  35.53 
 
 
164 aa  97.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636068  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0693  PBP family phospholipid-binding protein  35.53 
 
 
164 aa  97.4  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0102847 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1597  PEBP family protein  35.85 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  33.73 
 
 
181 aa  94.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  39.53 
 
 
185 aa  94.4  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1700  PEBP family protein  32.78 
 
 
185 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  34.78 
 
 
180 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1447  PEBP family protein  41.04 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  31.72 
 
 
182 aa  91.7  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3134  PEBP family protein  37.5 
 
 
206 aa  90.9  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0280  PBP family phospholipid-binding protein  30.65 
 
 
182 aa  90.9  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  32.94 
 
 
181 aa  90.9  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  38.13 
 
 
181 aa  90.1  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  37.78 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  33.54 
 
 
155 aa  90.5  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  34.64 
 
 
617 aa  90.1  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  36.67 
 
 
182 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8937  PEBP family protein  36.3 
 
 
173 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.995518  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  36.67 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3163  PBP family phospholipid-binding protein  34.67 
 
 
178 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.650541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3225  PBP family phospholipid-binding protein  34.67 
 
 
178 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  36.67 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3175  PBP family phospholipid-binding protein  34.67 
 
 
178 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273283  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06342  hypothetical protein  35.17 
 
 
177 aa  89.4  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  31.32 
 
 
184 aa  89  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  38.13 
 
 
157 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  30.65 
 
 
182 aa  88.6  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  36 
 
 
182 aa  88.2  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  36 
 
 
182 aa  88.2  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0985  PEBP family protein  32.92 
 
 
189 aa  88.2  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340221  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  35.29 
 
 
156 aa  88.2  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2035  putative kinase inhibitor  34.03 
 
 
183 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  33.52 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0594  hypothetical protein  30 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  34.59 
 
 
183 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  32.59 
 
 
154 aa  85.9  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  32.85 
 
 
149 aa  85.5  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001407  phospholipid-binding protein  42.57 
 
 
177 aa  85.5  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  33.33 
 
 
183 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0316  phosphatidylethanolamine-binding protein  31.87 
 
 
159 aa  85.1  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0858  PEBP family protein  30.13 
 
 
174 aa  85.1  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  35.29 
 
 
150 aa  84.7  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3038  PEBP family protein  31.06 
 
 
178 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  32.85 
 
 
149 aa  84.3  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4403  PEBP family protein  33.77 
 
 
174 aa  84  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4884  hypothetical protein  33.13 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  33.54 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0871  PEBP family protein  30.63 
 
 
177 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.393701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  30 
 
 
179 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  33.54 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3488  PEBP family protein  30.91 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274615  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6697  Phospholipid-binding protein-like protein  31.91 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.066957  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  32.6 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  36.18 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  37.41 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  35.56 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  32.26 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  32.04 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  32.04 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  35.17 
 
 
176 aa  82  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1246  PEBP family protein  36.96 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  32.32 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3516  PEBP family protein  31.48 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2590  PEBP family protein  31.48 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38600  phospholipid-binding protein, PBP family  30.43 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2774  PBP family phospholipid-binding protein  38.4 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.504548  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0279  PBP family phospholipid-binding protein  38.24 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1956  hypothetical protein  36.19 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  37.78 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  35.51 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  32.08 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  32.04 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3047  hypothetical protein  31.06 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1141  PEBP family protein  38.98 
 
 
167 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3372  PBP family phospholipid-binding protein  40.38 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00311199  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2718  PEBP family protein  34.75 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  36.73 
 
 
153 aa  79  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1917  PEBP family protein  34.46 
 
 
174 aa  79  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.184289 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12230  conserved hypothetical protein TIGR00481  33.12 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.888512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8369  PEBP family protein  33.56 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632838  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1618  PEBP family protein  31.71 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.82166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  31.49 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  36.92 
 
 
150 aa  77  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3314  PEBP family protein  32.64 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  30.05 
 
 
185 aa  77  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>