260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0316 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0316  phosphatidylethanolamine-binding protein  100 
 
 		 159 aa  329  7.000000000000001e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0280  PBP family phospholipid-binding protein  89.94 
 
 		 182 aa  301  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  89.31 
 
 		 182 aa  296  8e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  88.68 
 
 		 182 aa  293  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  81.13 
 
 		 179 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  80.5 
 
 		 179 aa  270  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  79.87 
 
 		 179 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  79.87 
 
 		 179 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0594  hypothetical protein  62.03 
 
 		 180 aa  210  5.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4884  hypothetical protein  55.28 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  56.69 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0871  PEBP family protein  57.86 
 
 		 177 aa  185  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.393701 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1917  PEBP family protein  54.37 
 
 		 174 aa  185  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.184289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1700  PEBP family protein  56.33 
 
 		 185 aa  184  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  54.37 
 
 		 190 aa  184  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1246  PEBP family protein  53.75 
 
 		 175 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3047  hypothetical protein  52.17 
 
 		 185 aa  178  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  56.77 
 
 		 182 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  51.88 
 
 		 181 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  56.77 
 
 		 182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  56.77 
 
 		 182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  54.72 
 
 		 184 aa  170  6.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  55.35 
 
 		 179 aa  170  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  56.13 
 
 		 182 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  56.13 
 
 		 182 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  50 
 
 		 181 aa  168  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1992  PEBP family protein  53.75 
 
 		 180 aa  167  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001407  phospholipid-binding protein  51.9 
 
 		 177 aa  167  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06342  hypothetical protein  51.27 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3134  PEBP family protein  52.17 
 
 		 206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2035  putative kinase inhibitor  50 
 
 		 183 aa  161  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0942  putative kinase inhibitor protein  51.27 
 
 		 158 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  49.37 
 
 		 183 aa  160  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  49.37 
 
 		 183 aa  160  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3962  YbcL  51.25 
 
 		 189 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815606  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0856  putative kinase inhibitor protein  50.63 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.524056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0919  putative kinase inhibitor protein  50.63 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0887  putative kinase inhibitor protein  50.63 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0828  putative kinase inhibitor protein  50.63 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.354915  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0985  PEBP family protein  52.17 
 
 		 189 aa  158  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340221  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0693  PBP family phospholipid-binding protein  49.69 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0102847 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0671  PEBP family protein  49.69 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636068  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1597  PEBP family protein  50.32 
 
 		 183 aa  155  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1308  putative kinase inhibitor protein  50.64 
 
 		 160 aa  153  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0921  putative kinase inhibitor protein  48.73 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168155  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00740  predicted kinase inhibitor  48.73 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0173432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2869  PEBP family protein  48.73 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0827  putative kinase inhibitor protein  48.73 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000771777  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2870  putative kinase inhibitor protein  48.73 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0113599  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0836  putative kinase inhibitor protein  48.73 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.145482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00757  hypothetical protein  48.73 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259899  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2579  putative kinase inhibitor protein  48.73 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0939329  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0796  putative kinase inhibitor protein  48.73 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0510178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3288  PEBP family protein  50 
 
 		 176 aa  150  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0439012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2129  PEBP family protein  50.93 
 
 		 178 aa  148  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1447  PEBP family protein  47.47 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3314  PEBP family protein  47.2 
 
 		 179 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1145  putative kinase inhibitor protein  51.25 
 
 		 163 aa  144  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38600  phospholipid-binding protein, PBP family  49.38 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  47.06 
 
 		 207 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2718  PEBP family protein  48.43 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4302  PEBP family protein  43.48 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2434  PEBP family protein  45.96 
 
 		 181 aa  139  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0392819  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3163  PBP family phospholipid-binding protein  44.72 
 
 		 178 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.650541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3225  PBP family phospholipid-binding protein  44.72 
 
 		 178 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3175  PBP family phospholipid-binding protein  44.72 
 
 		 178 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3837  YbhB and YbcL  42.86 
 
 		 190 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0780  PEBP family protein  49.69 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2615  YbhB and YbcL  42.94 
 
 		 247 aa  136  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0019  PEBP family protein  45.34 
 
 		 180 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3488  PEBP family protein  44.1 
 
 		 178 aa  131  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274615  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0033  PBP family phospholipid-binding protein  44.1 
 
 		 180 aa  131  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12170  hypothetical protein  45 
 
 		 176 aa  131  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.662377 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0858  PEBP family protein  43.04 
 
 		 174 aa  130  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3038  PEBP family protein  44.1 
 
 		 178 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0912  PBP family phospholipid-binding protein  45.28 
 
 		 178 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0224568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2475  PEBP family protein  48.08 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.276536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8937  PEBP family protein  44.38 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.995518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2116  PBP family phospholipid-binding protein  45.62 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2774  PBP family phospholipid-binding protein  43.12 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.504548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5877  PEBP family protein  43.67 
 
 		 175 aa  128  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4403  PEBP family protein  46.2 
 
 		 174 aa  128  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3372  PBP family phospholipid-binding protein  43.29 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00311199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1141  PEBP family protein  42.07 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2590  PEBP family protein  40.88 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3516  PEBP family protein  40.88 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2196  PEBP family protein  39.87 
 
 		 180 aa  124  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00567412  hitchhiker  0.00102935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6437  PEBP family protein  42.68 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2599  PBP family phospholipid-binding protein  42.5 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0610588  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3014  hypothetical protein  43.84 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1269  hypothetical protein  43.84 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4535  PEBP family protein  40.88 
 
 		 177 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.460349  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0969  hypothetical protein  43.84 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3037  hypothetical protein  43.84 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930194  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1108  hypothetical protein  43.84 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1114  phosphatidylethanolamine-binding protein  43.84 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1558  hypothetical protein  44.14 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21340  phospholipid-binding protein, PBP family  40.51 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437018  normal  0.157291 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1956  hypothetical protein  48.23 
 
 		 202 aa  118  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2290  PEBP family protein  38.75 
 
 		 175 aa  117  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>