266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4302 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4302  PEBP family protein  100 
 
 
190 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3837  YbhB and YbcL  96.32 
 
 
190 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6697  Phospholipid-binding protein-like protein  62.11 
 
 
192 aa  254  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.066957  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2400  PEBP family protein  66.31 
 
 
190 aa  238  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1308  putative kinase inhibitor protein  49.66 
 
 
160 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  42.39 
 
 
182 aa  148  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  44.26 
 
 
181 aa  148  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  48.03 
 
 
179 aa  148  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0280  PBP family phospholipid-binding protein  41.85 
 
 
182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  41.85 
 
 
182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  42.68 
 
 
179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  42.68 
 
 
179 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4884  hypothetical protein  39.46 
 
 
186 aa  144  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  42.07 
 
 
179 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  42.07 
 
 
179 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  42.86 
 
 
181 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1992  PEBP family protein  46.67 
 
 
180 aa  142  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  47.59 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0316  phosphatidylethanolamine-binding protein  43.48 
 
 
159 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2774  PBP family phospholipid-binding protein  42.59 
 
 
169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.504548  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0942  putative kinase inhibitor protein  43.87 
 
 
158 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.770781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00740  predicted kinase inhibitor  44.52 
 
 
158 aa  137  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0173432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2869  PEBP family protein  44.52 
 
 
158 aa  137  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00757  hypothetical protein  44.52 
 
 
158 aa  137  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259899  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0836  putative kinase inhibitor protein  44.52 
 
 
158 aa  137  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.145482  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0827  putative kinase inhibitor protein  44.52 
 
 
158 aa  137  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000771777  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2870  putative kinase inhibitor protein  44.52 
 
 
158 aa  137  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0113599  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0919  putative kinase inhibitor protein  43.23 
 
 
158 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0887  putative kinase inhibitor protein  43.23 
 
 
158 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0796  putative kinase inhibitor protein  43.87 
 
 
158 aa  136  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0510178  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0856  putative kinase inhibitor protein  43.23 
 
 
158 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.524056  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0921  putative kinase inhibitor protein  43.87 
 
 
158 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168155  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0828  putative kinase inhibitor protein  43.23 
 
 
158 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.354915  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2579  putative kinase inhibitor protein  43.87 
 
 
158 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0939329  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1246  PEBP family protein  42.22 
 
 
175 aa  135  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  42.95 
 
 
182 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  42.95 
 
 
182 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3134  PEBP family protein  41.36 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1145  putative kinase inhibitor protein  52.67 
 
 
163 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1917  PEBP family protein  40.68 
 
 
174 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.184289 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  42.95 
 
 
182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  42.95 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2615  YbhB and YbcL  46.1 
 
 
247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  42.95 
 
 
182 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0594  hypothetical protein  39.01 
 
 
180 aa  132  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  40.44 
 
 
183 aa  130  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  40.44 
 
 
183 aa  130  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1447  PEBP family protein  40.11 
 
 
181 aa  130  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  40.11 
 
 
190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  46.81 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0279  PBP family phospholipid-binding protein  44.3 
 
 
200 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181285 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3962  YbcL  45.03 
 
 
189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815606  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  40 
 
 
179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2035  putative kinase inhibitor  39.67 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3047  hypothetical protein  39.77 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0985  PEBP family protein  45.14 
 
 
189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340221  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0871  PEBP family protein  43.66 
 
 
177 aa  125  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.393701 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1597  PEBP family protein  39.87 
 
 
183 aa  125  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0033  PBP family phospholipid-binding protein  43.43 
 
 
180 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1956  hypothetical protein  35.64 
 
 
202 aa  121  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0671  PEBP family protein  41.4 
 
 
164 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636068  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0019  PEBP family protein  43.45 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0693  PBP family phospholipid-binding protein  41.4 
 
 
164 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0102847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1700  PEBP family protein  40.48 
 
 
185 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5877  PEBP family protein  40.76 
 
 
175 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3314  PEBP family protein  38.98 
 
 
179 aa  115  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0780  PEBP family protein  48.32 
 
 
162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2475  PEBP family protein  41.38 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.276536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4403  PEBP family protein  42.77 
 
 
174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2129  PEBP family protein  39.87 
 
 
178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0912  PBP family phospholipid-binding protein  39.77 
 
 
178 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0224568  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0904  hypothetical protein  40.26 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3014  hypothetical protein  40.26 
 
 
170 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1269  hypothetical protein  40.26 
 
 
170 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1141  PEBP family protein  39.86 
 
 
167 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0969  hypothetical protein  40.26 
 
 
170 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3037  hypothetical protein  40.26 
 
 
170 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930194  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1108  hypothetical protein  40.26 
 
 
170 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1114  phosphatidylethanolamine-binding protein  40.26 
 
 
170 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3288  PEBP family protein  40.25 
 
 
176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0439012  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1558  hypothetical protein  41.22 
 
 
154 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06342  hypothetical protein  34.64 
 
 
177 aa  108  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2196  PEBP family protein  37.74 
 
 
180 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00567412  hitchhiker  0.00102935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3372  PBP family phospholipid-binding protein  38.57 
 
 
167 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00311199  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001407  phospholipid-binding protein  40.14 
 
 
177 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3038  PEBP family protein  37.66 
 
 
178 aa  104  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3678  PEBP family protein  44.3 
 
 
200 aa  104  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0516944  hitchhiker  0.0000000000615419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2718  PEBP family protein  38.99 
 
 
181 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  38.82 
 
 
185 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0858  PEBP family protein  35.4 
 
 
174 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  38.89 
 
 
180 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2434  PEBP family protein  35.8 
 
 
181 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0392819  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2873  PEBP family protein  43.45 
 
 
205 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0480735  hitchhiker  0.00000000000191447 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2588  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  39.11 
 
 
191 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0021  phosphatidylethanolamine-binding protein  39.11 
 
 
198 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3163  PBP family phospholipid-binding protein  36.2 
 
 
178 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.650541  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3790  putative phosphatidylethanolamine-binding protein  39.11 
 
 
198 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.595707  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3852  putative phosphatidylethanolamine-binding protein  39.11 
 
 
191 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3175  PBP family phospholipid-binding protein  36.2 
 
 
178 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273283  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3521  putative phosphatidylethanolamine-binding protein  39.11 
 
 
191 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>