267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1506 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  100 
 
 
190 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4884  hypothetical protein  58.89 
 
 
186 aa  233  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  66.87 
 
 
179 aa  229  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1700  PEBP family protein  61.58 
 
 
185 aa  226  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3047  hypothetical protein  57.89 
 
 
185 aa  215  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0671  PEBP family protein  55.56 
 
 
164 aa  187  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636068  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0693  PBP family phospholipid-binding protein  55.56 
 
 
164 aa  187  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0102847 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0316  phosphatidylethanolamine-binding protein  54.37 
 
 
159 aa  184  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0280  PBP family phospholipid-binding protein  49.43 
 
 
182 aa  184  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3134  PEBP family protein  48.94 
 
 
206 aa  184  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  53.37 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  50 
 
 
182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  52.76 
 
 
179 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  52.15 
 
 
179 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  52.15 
 
 
179 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  52.17 
 
 
181 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  52.15 
 
 
182 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  48.89 
 
 
181 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0985  PEBP family protein  52.69 
 
 
189 aa  176  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340221  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1992  PEBP family protein  49.44 
 
 
180 aa  175  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  48.57 
 
 
183 aa  174  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2035  putative kinase inhibitor  47.73 
 
 
183 aa  175  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  48.57 
 
 
183 aa  174  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0594  hypothetical protein  52.47 
 
 
180 aa  174  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  47.54 
 
 
184 aa  169  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1246  PEBP family protein  49.44 
 
 
175 aa  169  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1597  PEBP family protein  51.27 
 
 
183 aa  168  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3962  YbcL  47.54 
 
 
189 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815606  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  48.47 
 
 
179 aa  165  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  51.61 
 
 
182 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1917  PEBP family protein  48.15 
 
 
174 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.184289 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  51.61 
 
 
182 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  51.61 
 
 
182 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  51.61 
 
 
182 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  51.61 
 
 
182 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0871  PEBP family protein  44.21 
 
 
177 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.393701 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06342  hypothetical protein  47.16 
 
 
177 aa  159  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001407  phospholipid-binding protein  47.73 
 
 
177 aa  158  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0904  hypothetical protein  53.69 
 
 
167 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1308  putative kinase inhibitor protein  49.38 
 
 
160 aa  153  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  46.25 
 
 
207 aa  153  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2615  YbhB and YbcL  45.96 
 
 
247 aa  152  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3314  PEBP family protein  47.53 
 
 
179 aa  149  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3163  PBP family phospholipid-binding protein  46.3 
 
 
178 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.650541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3225  PBP family phospholipid-binding protein  46.3 
 
 
178 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3175  PBP family phospholipid-binding protein  46.3 
 
 
178 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273283  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1558  hypothetical protein  51.68 
 
 
154 aa  148  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3014  hypothetical protein  51.68 
 
 
170 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1269  hypothetical protein  51.68 
 
 
170 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0969  hypothetical protein  51.68 
 
 
170 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3037  hypothetical protein  51.68 
 
 
170 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930194  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1108  hypothetical protein  51.68 
 
 
170 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1114  phosphatidylethanolamine-binding protein  51.68 
 
 
170 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1145  putative kinase inhibitor protein  47.24 
 
 
163 aa  148  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0858  PEBP family protein  46.58 
 
 
174 aa  148  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2718  PEBP family protein  46.25 
 
 
181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38600  phospholipid-binding protein, PBP family  46.3 
 
 
182 aa  145  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0942  putative kinase inhibitor protein  44.65 
 
 
158 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3288  PEBP family protein  45.34 
 
 
176 aa  143  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0439012  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0033  PBP family phospholipid-binding protein  44.1 
 
 
180 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3372  PBP family phospholipid-binding protein  49.07 
 
 
167 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00311199  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2129  PEBP family protein  48.15 
 
 
178 aa  142  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1447  PEBP family protein  41.76 
 
 
181 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12170  hypothetical protein  46.3 
 
 
176 aa  142  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.662377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5877  PEBP family protein  46.54 
 
 
175 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0887  putative kinase inhibitor protein  44.03 
 
 
158 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1141  PEBP family protein  47.83 
 
 
167 aa  141  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0856  putative kinase inhibitor protein  44.03 
 
 
158 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.524056  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0919  putative kinase inhibitor protein  44.03 
 
 
158 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0828  putative kinase inhibitor protein  44.03 
 
 
158 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.354915  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3516  PEBP family protein  43.4 
 
 
165 aa  141  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2590  PEBP family protein  43.4 
 
 
165 aa  141  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0921  putative kinase inhibitor protein  43.4 
 
 
158 aa  141  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168155  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0796  putative kinase inhibitor protein  43.4 
 
 
158 aa  141  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0510178  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00740  predicted kinase inhibitor  43.4 
 
 
158 aa  141  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0173432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2869  PEBP family protein  43.4 
 
 
158 aa  141  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0836  putative kinase inhibitor protein  43.4 
 
 
158 aa  141  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.145482  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0827  putative kinase inhibitor protein  43.4 
 
 
158 aa  141  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000771777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00757  hypothetical protein  43.4 
 
 
158 aa  141  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259899  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2870  putative kinase inhibitor protein  43.4 
 
 
158 aa  141  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0113599  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2579  putative kinase inhibitor protein  43.4 
 
 
158 aa  140  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0939329  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3488  PEBP family protein  45.06 
 
 
178 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274615  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0780  PEBP family protein  49.39 
 
 
162 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0019  PEBP family protein  43.83 
 
 
180 aa  138  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2434  PEBP family protein  45.34 
 
 
181 aa  137  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0392819  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4403  PEBP family protein  46.25 
 
 
174 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2142  PEBP family protein  46.88 
 
 
169 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  hitchhiker  0.000233727 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3038  PEBP family protein  42.94 
 
 
178 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0912  PBP family phospholipid-binding protein  44.38 
 
 
178 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0224568  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2116  PBP family phospholipid-binding protein  45.34 
 
 
178 aa  132  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2599  PBP family phospholipid-binding protein  45.96 
 
 
175 aa  131  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0610588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8937  PEBP family protein  42.86 
 
 
173 aa  131  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.995518  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  44.44 
 
 
180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4302  PEBP family protein  40.11 
 
 
190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6437  PEBP family protein  41.98 
 
 
171 aa  129  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1618  PEBP family protein  42.86 
 
 
171 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.82166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3837  YbhB and YbcL  39.55 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4114  PEBP family protein  41.61 
 
 
177 aa  122  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2196  PEBP family protein  39.75 
 
 
180 aa  122  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00567412  hitchhiker  0.00102935 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04720  phospholipid-binding protein, PBP family  42.24 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.583132  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>