259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1447 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1447  PEBP family protein  100 
 
 		 181 aa  370  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1246  PEBP family protein  47.46 
 
 		 175 aa  166  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1992  PEBP family protein  43.96 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1308  putative kinase inhibitor protein  52.53 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  50 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  50 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  49.69 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  49.69 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  47.75 
 
 		 184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1917  PEBP family protein  47.5 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.184289 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  50.61 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0887  putative kinase inhibitor protein  50 
 
 		 158 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0919  putative kinase inhibitor protein  50 
 
 		 158 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0856  putative kinase inhibitor protein  50 
 
 		 158 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.524056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0828  putative kinase inhibitor protein  50 
 
 		 158 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.354915  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  44.75 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0942  putative kinase inhibitor protein  50 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1597  PEBP family protein  48.12 
 
 		 183 aa  158  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  46.7 
 
 		 182 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  46.7 
 
 		 182 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4884  hypothetical protein  43.24 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0921  putative kinase inhibitor protein  49.36 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  46.7 
 
 		 182 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00740  predicted kinase inhibitor  48.72 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0173432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2869  PEBP family protein  48.72 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2870  putative kinase inhibitor protein  48.72 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0113599  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0827  putative kinase inhibitor protein  48.72 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000771777  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0871  PEBP family protein  42.13 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.393701 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0836  putative kinase inhibitor protein  48.72 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.145482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00757  hypothetical protein  48.72 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259899  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2579  putative kinase inhibitor protein  49.36 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0939329  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  48.03 
 
 		 182 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0796  putative kinase inhibitor protein  48.72 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0510178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1700  PEBP family protein  43.96 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  47.37 
 
 		 182 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  43.72 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001407  phospholipid-binding protein  47.5 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3134  PEBP family protein  46.95 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  47.47 
 
 		 181 aa  151  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  43.72 
 
 		 182 aa  151  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0594  hypothetical protein  47.71 
 
 		 180 aa  151  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0280  PBP family phospholipid-binding protein  42.62 
 
 		 182 aa  150  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0985  PEBP family protein  53.96 
 
 		 189 aa  150  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340221  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06342  hypothetical protein  42.46 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3962  YbcL  45.16 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815606  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  41.9 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0671  PEBP family protein  48.15 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636068  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2035  putative kinase inhibitor  44.44 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0693  PBP family phospholipid-binding protein  48.15 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0102847 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  41.9 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0316  phosphatidylethanolamine-binding protein  47.47 
 
 		 159 aa  149  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  44.07 
 
 		 179 aa  147  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3047  hypothetical protein  43.86 
 
 		 185 aa  147  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0780  PEBP family protein  53.12 
 
 		 162 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  41.76 
 
 		 190 aa  142  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0019  PEBP family protein  45.4 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  42.68 
 
 		 207 aa  136  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2615  YbhB and YbcL  42.42 
 
 		 247 aa  136  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1956  hypothetical protein  48.15 
 
 		 202 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0858  PEBP family protein  44.87 
 
 		 174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1145  putative kinase inhibitor protein  48.75 
 
 		 163 aa  134  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3288  PEBP family protein  45.91 
 
 		 176 aa  130  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0439012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3837  YbhB and YbcL  40.11 
 
 		 190 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4302  PEBP family protein  40.11 
 
 		 190 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2774  PBP family phospholipid-binding protein  40.59 
 
 		 169 aa  127  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.504548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0033  PBP family phospholipid-binding protein  41.61 
 
 		 180 aa  127  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1141  PEBP family protein  44.76 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2475  PEBP family protein  43.48 
 
 		 164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.276536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8937  PEBP family protein  45.83 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.995518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12230  conserved hypothetical protein TIGR00481  44.87 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.888512  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3372  PBP family phospholipid-binding protein  44.76 
 
 		 167 aa  124  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00311199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2116  PBP family phospholipid-binding protein  42.77 
 
 		 178 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6697  Phospholipid-binding protein-like protein  42.61 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.066957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2718  PEBP family protein  41.88 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2196  PEBP family protein  40.25 
 
 		 180 aa  122  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00567412  hitchhiker  0.00102935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38600  phospholipid-binding protein, PBP family  42.5 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  42.61 
 
 		 185 aa  120  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2400  PEBP family protein  42.24 
 
 		 190 aa  120  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0904  hypothetical protein  45.14 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4535  PEBP family protein  39.1 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.460349  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2142  PEBP family protein  42.47 
 
 		 169 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  hitchhiker  0.000233727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  41.36 
 
 		 180 aa  118  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1558  hypothetical protein  44.44 
 
 		 154 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3014  hypothetical protein  44.44 
 
 		 170 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1269  hypothetical protein  44.44 
 
 		 170 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0969  hypothetical protein  44.44 
 
 		 170 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3037  hypothetical protein  44.44 
 
 		 170 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930194  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1108  hypothetical protein  44.44 
 
 		 170 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1114  phosphatidylethanolamine-binding protein  44.44 
 
 		 170 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04720  phospholipid-binding protein, PBP family  41.25 
 
 		 179 aa  117  7e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.583132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0279  PBP family phospholipid-binding protein  44.44 
 
 		 200 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181285 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0912  PBP family phospholipid-binding protein  39.49 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0224568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3516  PEBP family protein  36.02 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2590  PEBP family protein  36.02 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3314  PEBP family protein  43.42 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4403  PEBP family protein  41.88 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5877  PEBP family protein  37.74 
 
 		 175 aa  114  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2129  PEBP family protein  40.74 
 
 		 178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2434  PEBP family protein  40 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0392819  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4114  PEBP family protein  38.82 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>