266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1458 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  100 
 
 
184 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  66.87 
 
 
179 aa  235  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3134  PEBP family protein  59.78 
 
 
206 aa  218  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0671  PEBP family protein  62.11 
 
 
164 aa  215  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636068  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0693  PBP family phospholipid-binding protein  62.11 
 
 
164 aa  215  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0102847 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3962  YbcL  56.91 
 
 
189 aa  209  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815606  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0985  PEBP family protein  60.12 
 
 
189 aa  208  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340221  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  56.42 
 
 
183 aa  204  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  56.42 
 
 
183 aa  204  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2035  putative kinase inhibitor  55.87 
 
 
183 aa  202  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4884  hypothetical protein  50.54 
 
 
186 aa  198  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  50.54 
 
 
181 aa  197  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  49.73 
 
 
181 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  60.14 
 
 
182 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  60.14 
 
 
182 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  60.14 
 
 
182 aa  188  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  60.14 
 
 
182 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  60.14 
 
 
182 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0871  PEBP family protein  51.63 
 
 
177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.393701 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  54.88 
 
 
207 aa  182  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1992  PEBP family protein  52.17 
 
 
180 aa  182  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0780  PEBP family protein  59.26 
 
 
162 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2615  YbhB and YbcL  53.05 
 
 
247 aa  180  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  56.6 
 
 
179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  51.09 
 
 
182 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  52.94 
 
 
182 aa  177  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1700  PEBP family protein  49.72 
 
 
185 aa  177  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3047  hypothetical protein  47.83 
 
 
185 aa  176  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  55.35 
 
 
179 aa  175  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1308  putative kinase inhibitor protein  54.09 
 
 
160 aa  175  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  55.35 
 
 
179 aa  175  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3314  PEBP family protein  53.99 
 
 
179 aa  174  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  55.35 
 
 
179 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0280  PBP family phospholipid-binding protein  48.37 
 
 
182 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1917  PEBP family protein  46.99 
 
 
174 aa  171  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.184289 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0316  phosphatidylethanolamine-binding protein  54.72 
 
 
159 aa  170  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  47.54 
 
 
190 aa  169  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0594  hypothetical protein  47.25 
 
 
180 aa  167  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  49.4 
 
 
179 aa  167  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0887  putative kinase inhibitor protein  50.94 
 
 
158 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0828  putative kinase inhibitor protein  50.94 
 
 
158 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.354915  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0856  putative kinase inhibitor protein  50.94 
 
 
158 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.524056  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0919  putative kinase inhibitor protein  50.94 
 
 
158 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1597  PEBP family protein  50.32 
 
 
183 aa  165  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0942  putative kinase inhibitor protein  50.31 
 
 
158 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.770781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00740  predicted kinase inhibitor  52.2 
 
 
158 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0173432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2869  PEBP family protein  52.2 
 
 
158 aa  164  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0836  putative kinase inhibitor protein  52.2 
 
 
158 aa  164  9e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.145482  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0827  putative kinase inhibitor protein  52.2 
 
 
158 aa  164  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000771777  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2870  putative kinase inhibitor protein  52.2 
 
 
158 aa  164  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0113599  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00757  hypothetical protein  52.2 
 
 
158 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259899  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0921  putative kinase inhibitor protein  51.57 
 
 
158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168155  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1145  putative kinase inhibitor protein  52.8 
 
 
163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0796  putative kinase inhibitor protein  51.57 
 
 
158 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0510178  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1447  PEBP family protein  47.75 
 
 
181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2579  putative kinase inhibitor protein  51.57 
 
 
158 aa  162  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0939329  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2142  PEBP family protein  46.34 
 
 
169 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  hitchhiker  0.000233727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0019  PEBP family protein  48.77 
 
 
180 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38600  phospholipid-binding protein, PBP family  51.25 
 
 
182 aa  158  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8937  PEBP family protein  50.32 
 
 
173 aa  157  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.995518  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06342  hypothetical protein  47.16 
 
 
177 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3372  PBP family phospholipid-binding protein  48.45 
 
 
167 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00311199  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1246  PEBP family protein  45.86 
 
 
175 aa  155  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2718  PEBP family protein  48.43 
 
 
181 aa  155  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3014  hypothetical protein  46.91 
 
 
170 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1269  hypothetical protein  46.91 
 
 
170 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0969  hypothetical protein  46.91 
 
 
170 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3037  hypothetical protein  46.91 
 
 
170 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930194  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1108  hypothetical protein  46.91 
 
 
170 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1114  phosphatidylethanolamine-binding protein  46.91 
 
 
170 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001407  phospholipid-binding protein  44.26 
 
 
177 aa  155  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0904  hypothetical protein  46.3 
 
 
167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1558  hypothetical protein  50.69 
 
 
154 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2129  PEBP family protein  49.69 
 
 
178 aa  154  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  45.14 
 
 
185 aa  153  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1141  PEBP family protein  46.91 
 
 
167 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3516  PEBP family protein  43.83 
 
 
165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2590  PEBP family protein  43.83 
 
 
165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0858  PEBP family protein  47.5 
 
 
174 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5877  PEBP family protein  47.8 
 
 
175 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0033  PBP family phospholipid-binding protein  45.96 
 
 
180 aa  147  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3288  PEBP family protein  46.88 
 
 
176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0439012  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2434  PEBP family protein  45.96 
 
 
181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0392819  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4403  PEBP family protein  46.88 
 
 
174 aa  145  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3163  PBP family phospholipid-binding protein  43.75 
 
 
178 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.650541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3225  PBP family phospholipid-binding protein  43.75 
 
 
178 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3175  PBP family phospholipid-binding protein  43.75 
 
 
178 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273283  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3038  PEBP family protein  44.65 
 
 
178 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0912  PBP family phospholipid-binding protein  45.28 
 
 
178 aa  143  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0224568  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2475  PEBP family protein  46.71 
 
 
164 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.276536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2774  PBP family phospholipid-binding protein  42.68 
 
 
169 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.504548  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3837  YbhB and YbcL  48.28 
 
 
190 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3488  PEBP family protein  43.75 
 
 
178 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274615  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12170  hypothetical protein  46.88 
 
 
176 aa  140  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.662377 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4302  PEBP family protein  47.59 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1956  hypothetical protein  40.51 
 
 
202 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21340  phospholipid-binding protein, PBP family  41.88 
 
 
176 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437018  normal  0.157291 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6697  Phospholipid-binding protein-like protein  40.74 
 
 
192 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.066957  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0279  PBP family phospholipid-binding protein  45.4 
 
 
200 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  45.51 
 
 
180 aa  135  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>