271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5858 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  100 
 
 
156 aa  322  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  53.59 
 
 
194 aa  178  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  50.32 
 
 
176 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  48.05 
 
 
193 aa  165  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  53.19 
 
 
191 aa  164  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  48.39 
 
 
176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  49.66 
 
 
153 aa  153  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  46.31 
 
 
150 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  45.64 
 
 
150 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  47.55 
 
 
153 aa  144  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  45.1 
 
 
200 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  44.37 
 
 
149 aa  142  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  47.71 
 
 
154 aa  140  8e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  46.85 
 
 
153 aa  140  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  43.03 
 
 
185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  46.45 
 
 
156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  45.27 
 
 
155 aa  137  7.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  44.9 
 
 
149 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  41.94 
 
 
184 aa  134  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  42.28 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  42.86 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  44.3 
 
 
183 aa  131  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  42.48 
 
 
157 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  47.65 
 
 
150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  44.22 
 
 
181 aa  128  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  47.06 
 
 
191 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  41.14 
 
 
206 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  47.37 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  44.44 
 
 
149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  40.51 
 
 
179 aa  122  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  39.88 
 
 
188 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  42.48 
 
 
156 aa  120  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  42.58 
 
 
157 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  41.03 
 
 
157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  41.73 
 
 
192 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  43.62 
 
 
150 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  39.73 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  41.1 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  40.65 
 
 
617 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  39.19 
 
 
175 aa  110  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  44.52 
 
 
159 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  44.52 
 
 
159 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  39.19 
 
 
175 aa  110  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4021  PEBP family protein  37.58 
 
 
180 aa  110  8.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00411793  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  38.06 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  40.94 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  41.72 
 
 
150 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  43.87 
 
 
159 aa  107  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  40.67 
 
 
158 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  41.33 
 
 
150 aa  104  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  40.67 
 
 
150 aa  103  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  40.79 
 
 
157 aa  103  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  38.06 
 
 
158 aa  102  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  34.55 
 
 
173 aa  102  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1321  PEBP family protein  41.13 
 
 
153 aa  101  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  35.53 
 
 
158 aa  101  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  37.75 
 
 
159 aa  101  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  39.74 
 
 
157 aa  100  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0803  PEBP family protein  41.03 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0756  PBP family phospholipid-binding protein  39.74 
 
 
159 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0807  PEBP family protein  41.03 
 
 
159 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270972  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  36.77 
 
 
190 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  38.41 
 
 
159 aa  98.2  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  36.48 
 
 
194 aa  98.2  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0898  PEBP family protein  35.48 
 
 
190 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1514  PEBP family protein  39.58 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0212174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0960  PEBP family protein  36.77 
 
 
190 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0174403 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3483  PEBP family protein  42.47 
 
 
149 aa  94  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0135  YbhB and YbcL  40.15 
 
 
152 aa  93.6  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2306  PEBP family protein  39.57 
 
 
169 aa  91.3  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369465  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0873  PBP family phospholipid-binding protein  34.84 
 
 
207 aa  89.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547082  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1322  PEBP family protein  38.73 
 
 
151 aa  87  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  34.19 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  33.12 
 
 
187 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1488  PEBP family protein  32.19 
 
 
169 aa  85.1  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  33.12 
 
 
187 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0538  PEBP family protein  36.91 
 
 
193 aa  85.1  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.092154  normal  0.34309 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1794  PEBP family protein  31.52 
 
 
210 aa  84.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  35.5 
 
 
180 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7099  PEBP family protein  41.48 
 
 
189 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  33.8 
 
 
179 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  33.8 
 
 
179 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11940  lipoprotein lppC  37.09 
 
 
201 aa  84  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  33.8 
 
 
179 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1038  PEBP family protein  35.19 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11939  hypothetical protein  35.95 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0182  PBP family phospholipid-binding protein  36.18 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333114  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3081  PEBP family protein  35.9 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625763  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2643  PEBP family protein  35.9 
 
 
183 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  33.8 
 
 
179 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6791  Phospholipid-binding protein-like protein  35.25 
 
 
188 aa  80.5  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.441972  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1447  PEBP family protein  38.57 
 
 
181 aa  80.5  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2785  PEBP family protein  35.76 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252116  normal  0.340055 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1789  PBP family phospholipid-binding protein  45.74 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  35.57 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3733  PBP family phospholipid-binding protein  32.91 
 
 
184 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0343  PEBP family protein  31.65 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1681  PEBP family protein  34 
 
 
192 aa  79  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0887  PEBP family protein  31.45 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8369  PEBP family protein  36.21 
 
 
199 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>