263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2903 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2903  PEBP family protein  100 
 
 
188 aa  370  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  54.49 
 
 
187 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  54.49 
 
 
187 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3733  PBP family phospholipid-binding protein  46.01 
 
 
184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2489  PEBP family protein  45.25 
 
 
183 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.182632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2785  PEBP family protein  45.11 
 
 
183 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252116  normal  0.340055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2643  PEBP family protein  45.81 
 
 
183 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3081  PEBP family protein  46.88 
 
 
158 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625763  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0182  PBP family phospholipid-binding protein  41.11 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333114  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7099  PEBP family protein  42.95 
 
 
189 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  35.33 
 
 
183 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  36.46 
 
 
193 aa  97.8  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  36.65 
 
 
184 aa  95.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  35.22 
 
 
175 aa  93.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  38.64 
 
 
179 aa  94.4  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  37.3 
 
 
185 aa  94  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  35.22 
 
 
175 aa  93.2  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  40.44 
 
 
200 aa  90.5  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  34.16 
 
 
155 aa  90.9  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0594  hypothetical protein  39.1 
 
 
180 aa  89.4  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  35.26 
 
 
181 aa  89  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  37.42 
 
 
153 aa  88.2  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1038  PEBP family protein  33.93 
 
 
187 aa  88.2  7e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4277  PEBP family protein  34.38 
 
 
153 aa  87.8  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246525  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  33.74 
 
 
154 aa  87  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  32.74 
 
 
159 aa  86.7  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  36.81 
 
 
158 aa  84.7  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8369  PEBP family protein  38.76 
 
 
199 aa  84.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632838  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  34.16 
 
 
149 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1992  PEBP family protein  36.99 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11940  lipoprotein lppC  40.43 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  35.93 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  32.74 
 
 
617 aa  82.4  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1447  PEBP family protein  31.87 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  31.52 
 
 
176 aa  82  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  34.84 
 
 
153 aa  82  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  33.33 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  37.1 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  30.32 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  31.25 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  34.57 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  34.97 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1488  PEBP family protein  32.93 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0871  PEBP family protein  36.05 
 
 
177 aa  80.9  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.393701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  35 
 
 
150 aa  80.5  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06342  hypothetical protein  38.41 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  34.57 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  44.9 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  37.5 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  35.19 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  33.54 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  29.45 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  35.85 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3134  PEBP family protein  35.67 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  33.33 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  31.97 
 
 
150 aa  77  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  33.95 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1246  PEBP family protein  33.33 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  32.37 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  28.32 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1917  PEBP family protein  35.37 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.184289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11939  hypothetical protein  36.48 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  34.18 
 
 
150 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  32.75 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  31.93 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  30.49 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001407  phospholipid-binding protein  36.71 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  31.52 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  28.83 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  35.48 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  30.54 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  30.18 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  40.4 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  40.4 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  40.4 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  40.4 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0316  phosphatidylethanolamine-binding protein  33.54 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0873  PBP family phospholipid-binding protein  31.71 
 
 
207 aa  74.3  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547082  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  31.33 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2196  PEBP family protein  35.25 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00567412  hitchhiker  0.00102935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  34.57 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  32.35 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0280  PBP family phospholipid-binding protein  32.93 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  30.12 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  30.12 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  34.18 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1700  PEBP family protein  35.93 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  33.54 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2590  PEBP family protein  33.33 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  32.48 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0133  PEBP family protein  33.74 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.372147 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3516  PEBP family protein  33.33 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0061  PEBP family protein  45.12 
 
 
154 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.758418  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  30.85 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  30.3 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  31.21 
 
 
207 aa  72  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2615  YbhB and YbcL  35.16 
 
 
247 aa  71.6  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  39.39 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  31.68 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2434  PEBP family protein  32.93 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0392819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>