258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4277 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4277  PEBP family protein  100 
 
 		 153 aa  316  7e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  46.71 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0061  PEBP family protein  46.05 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.758418  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  41.61 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  42.11 
 
 		 184 aa  110  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  41.06 
 
 		 183 aa  107  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  41.89 
 
 		 181 aa  104  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  42.28 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  39.74 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  41.89 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  39.07 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12170  hypothetical protein  40.88 
 
 		 176 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.662377 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  40.94 
 
 		 200 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3163  PBP family phospholipid-binding protein  38.12 
 
 		 178 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.650541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3225  PBP family phospholipid-binding protein  38.12 
 
 		 178 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3175  PBP family phospholipid-binding protein  38.12 
 
 		 178 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  40.62 
 
 		 190 aa  95.5  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  39.47 
 
 		 185 aa  94.4  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  36.02 
 
 		 187 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  36.02 
 
 		 187 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  38.56 
 
 		 193 aa  94  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38600  phospholipid-binding protein, PBP family  43.07 
 
 		 182 aa  93.2  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  40.27 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  40.26 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  39.07 
 
 		 176 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  37.42 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0671  PEBP family protein  35.8 
 
 		 164 aa  92  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636068  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0693  PBP family phospholipid-binding protein  35.8 
 
 		 164 aa  92  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0102847 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  38 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  40.27 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  42.31 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  37.5 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  38.78 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1202  PEBP family protein  35.53 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  37.18 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3488  PEBP family protein  35.62 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274615  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  40 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  38.16 
 
 		 175 aa  87.8  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2196  PEBP family protein  36.65 
 
 		 180 aa  88.2  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00567412  hitchhiker  0.00102935 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11940  lipoprotein lppC  38 
 
 		 201 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  38.46 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1308  putative kinase inhibitor protein  36.02 
 
 		 160 aa  87.8  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  37.58 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  38.16 
 
 		 175 aa  87.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  36.48 
 
 		 179 aa  87.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2903  PEBP family protein  34.38 
 
 		 188 aa  87.4  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  37.82 
 
 		 179 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3314  PEBP family protein  45.61 
 
 		 179 aa  87  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3038  PEBP family protein  36.65 
 
 		 178 aa  87  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  42.14 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1145  putative kinase inhibitor protein  34.78 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  42.14 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  36.08 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  38.41 
 
 		 192 aa  85.5  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0871  PEBP family protein  35.48 
 
 		 177 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.393701 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  38.71 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  37.33 
 
 		 176 aa  84.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  35.57 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12230  conserved hypothetical protein TIGR00481  41.54 
 
 		 161 aa  84  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.888512  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3288  PEBP family protein  34.59 
 
 		 176 aa  84  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0439012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  35 
 
 		 157 aa  84  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4884  hypothetical protein  36.88 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6437  PEBP family protein  33.33 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2290  PEBP family protein  36.36 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  36.13 
 
 		 617 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  36 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0019  PEBP family protein  35.44 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  36.64 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  36.64 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  36.64 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1597  PEBP family protein  35.38 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  36.64 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  36.3 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2116  PBP family phospholipid-binding protein  34.38 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2718  PEBP family protein  35.85 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1141  PEBP family protein  42.28 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  36.64 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3047  hypothetical protein  34.57 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  36.65 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04720  phospholipid-binding protein, PBP family  33.76 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.583132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  34.19 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0858  PEBP family protein  34.81 
 
 		 174 aa  80.5  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1681  PEBP family protein  32.69 
 
 		 192 aa  80.9  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1794  PEBP family protein  33.12 
 
 		 210 aa  80.5  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  36.42 
 
 		 179 aa  80.5  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11939  hypothetical protein  37.5 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1488  PEBP family protein  33.77 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  36.08 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0912  PBP family phospholipid-binding protein  35.26 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0224568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  37.58 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  37.27 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  36.36 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1618  PEBP family protein  32.45 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.82166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4114  PEBP family protein  32.47 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5877  PEBP family protein  33.99 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  35.48 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3372  PBP family phospholipid-binding protein  41.13 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00311199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  39.04 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  34.76 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  36.36 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>