238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11940 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11940  lipoprotein lppC  100 
 
 
201 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11939  hypothetical protein  64 
 
 
204 aa  214  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  42.07 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  43.15 
 
 
175 aa  108  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  43.15 
 
 
175 aa  108  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  39.46 
 
 
155 aa  106  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  40.69 
 
 
153 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  40 
 
 
153 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  38.99 
 
 
181 aa  105  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  40 
 
 
200 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  37.67 
 
 
176 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  40 
 
 
181 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  37.67 
 
 
176 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  42.76 
 
 
150 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  40.27 
 
 
184 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2306  PEBP family protein  39.29 
 
 
169 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369465  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  38.78 
 
 
149 aa  101  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  35.48 
 
 
156 aa  101  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  35.14 
 
 
150 aa  101  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  32.53 
 
 
193 aa  101  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  38.1 
 
 
149 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  35.76 
 
 
150 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4277  PEBP family protein  38 
 
 
153 aa  99  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246525  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  35.76 
 
 
150 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  37.67 
 
 
183 aa  98.2  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  31.94 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1681  PEBP family protein  36 
 
 
192 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  39.31 
 
 
149 aa  95.9  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  32.03 
 
 
157 aa  95.9  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  36.42 
 
 
150 aa  95.5  5e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  32.03 
 
 
185 aa  95.1  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6791  Phospholipid-binding protein-like protein  34.51 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.441972  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  40 
 
 
188 aa  91.7  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  34.67 
 
 
155 aa  91.7  6e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  33.33 
 
 
154 aa  89.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  37.09 
 
 
156 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  37.42 
 
 
157 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  39.51 
 
 
187 aa  88.2  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  39.51 
 
 
187 aa  88.2  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2903  PEBP family protein  37.72 
 
 
188 aa  87.8  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1700  PEBP family protein  36.42 
 
 
185 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1038  PEBP family protein  39.49 
 
 
187 aa  87.4  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  35.19 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  35.48 
 
 
157 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  35.19 
 
 
179 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  35.19 
 
 
179 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  35.19 
 
 
179 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  36.6 
 
 
179 aa  85.5  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3483  PEBP family protein  40.54 
 
 
149 aa  85.5  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  36.6 
 
 
156 aa  85.1  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1950  PBP family phospholipid-binding protein  36.11 
 
 
185 aa  84.7  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.141097  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4884  hypothetical protein  37.59 
 
 
186 aa  84.7  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  34.46 
 
 
149 aa  84.7  9e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  33.13 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  38.71 
 
 
159 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  38.71 
 
 
159 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  34.67 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  36.43 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1597  PEBP family protein  38.13 
 
 
183 aa  82  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1202  PEBP family protein  37.01 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  36.13 
 
 
158 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  33.33 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  31.94 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  33.33 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3047  hypothetical protein  35.86 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  36.84 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  36.84 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  40.54 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  37.58 
 
 
158 aa  79  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0280  PBP family phospholipid-binding protein  32.52 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0594  hypothetical protein  31.29 
 
 
180 aa  79  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0873  PBP family phospholipid-binding protein  34.87 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547082  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2899  PEBP family protein  32.74 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.970699  normal  0.309684 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  35.22 
 
 
159 aa  77.4  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  37.5 
 
 
153 aa  77.8  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  32.2 
 
 
149 aa  77  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  38.6 
 
 
190 aa  77  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  33.77 
 
 
158 aa  77  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  33.13 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7099  PEBP family protein  40.48 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  41.28 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  33.33 
 
 
617 aa  77  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  39.49 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  33.33 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  32.67 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0316  phosphatidylethanolamine-binding protein  32.7 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3733  PBP family phospholipid-binding protein  36.2 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2489  PEBP family protein  37.58 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.182632 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2774  PBP family phospholipid-binding protein  41.43 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.504548  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  37.42 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3081  PEBP family protein  35.9 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625763  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  34.64 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  31.13 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1917  PEBP family protein  30.77 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.184289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2643  PEBP family protein  35.9 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  34.62 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3134  PEBP family protein  36.84 
 
 
206 aa  72  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1246  PEBP family protein  31.82 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1794  PEBP family protein  34.62 
 
 
210 aa  71.2  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0133  PEBP family protein  40.16 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.372147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>