164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2899 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2899  PEBP family protein  100 
 
 
218 aa  431  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.970699  normal  0.309684 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1950  PBP family phospholipid-binding protein  44.44 
 
 
185 aa  141  9e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.141097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6791  Phospholipid-binding protein-like protein  35.58 
 
 
188 aa  128  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.441972  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2306  PEBP family protein  40.43 
 
 
169 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369465  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1681  PEBP family protein  35.52 
 
 
192 aa  99  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  30.39 
 
 
176 aa  89.4  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  31.71 
 
 
176 aa  88.6  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  34.3 
 
 
150 aa  84.3  0.000000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  30.81 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  31.71 
 
 
153 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  33.55 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  33.33 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  33.88 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  33.33 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  26.11 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  27.91 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  31.43 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  29.08 
 
 
153 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  29.14 
 
 
150 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11940  lipoprotein lppC  33.1 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0133  PEBP family protein  30.34 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.372147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  31.52 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  35.2 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  33.6 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  30.22 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  30.54 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  28.57 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  35.2 
 
 
150 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  27.65 
 
 
179 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  34.13 
 
 
179 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  27.67 
 
 
153 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3081  PEBP family protein  36.3 
 
 
158 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625763  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2489  PEBP family protein  35.82 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.182632 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  30.89 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2643  PEBP family protein  36.3 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  28.14 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  29.75 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2785  PEBP family protein  35.82 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252116  normal  0.340055 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  28.82 
 
 
150 aa  64.3  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  26.9 
 
 
154 aa  63.9  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  29.41 
 
 
153 aa  62.8  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  36.5 
 
 
617 aa  62.8  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  40.86 
 
 
156 aa  62.4  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  29.38 
 
 
191 aa  62.4  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  27.75 
 
 
185 aa  62.4  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  31.61 
 
 
159 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  31.61 
 
 
159 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  25.73 
 
 
155 aa  62  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  30.56 
 
 
190 aa  62  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  30.41 
 
 
184 aa  61.6  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3483  PEBP family protein  35.42 
 
 
149 aa  61.6  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  30.22 
 
 
157 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  28.49 
 
 
157 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  28.82 
 
 
158 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3314  PEBP family protein  31.03 
 
 
179 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0135  YbhB and YbcL  32.52 
 
 
152 aa  60.1  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  26.67 
 
 
190 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  33.05 
 
 
175 aa  58.5  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  33.05 
 
 
175 aa  58.5  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  26.83 
 
 
149 aa  58.5  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  28.65 
 
 
159 aa  58.5  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1141  PEBP family protein  29.66 
 
 
187 aa  58.2  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  28.74 
 
 
159 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3733  PBP family phospholipid-binding protein  33.07 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11939  hypothetical protein  30.88 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7099  PEBP family protein  35.62 
 
 
189 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  26.22 
 
 
149 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1038  PEBP family protein  30.22 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  34.68 
 
 
150 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  29.29 
 
 
191 aa  55.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0960  PEBP family protein  25.56 
 
 
190 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0174403 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  27.49 
 
 
159 aa  55.5  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  29.29 
 
 
155 aa  55.5  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3229  PBP family phospholipid-binding protein  26.9 
 
 
153 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  33.94 
 
 
181 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  32.35 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1700  PEBP family protein  28.25 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  32.35 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0898  PEBP family protein  26.14 
 
 
190 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  28.67 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  28.67 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1880  PEBP family protein  32.5 
 
 
663 aa  53.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  33 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  25.7 
 
 
184 aa  53.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1789  PBP family phospholipid-binding protein  33.33 
 
 
177 aa  52.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1514  PEBP family protein  30.48 
 
 
154 aa  52.8  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0212174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  27.66 
 
 
183 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  31.43 
 
 
182 aa  52  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2035  putative kinase inhibitor  28.67 
 
 
183 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0671  PEBP family protein  31.75 
 
 
164 aa  51.6  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636068  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0693  PBP family phospholipid-binding protein  31.75 
 
 
164 aa  51.6  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0102847 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  31.71 
 
 
157 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0343  PEBP family protein  29.41 
 
 
155 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0858  PEBP family protein  29.55 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  30.95 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1488  PEBP family protein  34.19 
 
 
169 aa  50.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  33 
 
 
182 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3962  YbcL  27.56 
 
 
189 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815606  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  33 
 
 
182 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  33 
 
 
182 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>