241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1789 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1789  PBP family phospholipid-binding protein  100 
 
 
177 aa  343  6e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  37.25 
 
 
185 aa  108  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  50.5 
 
 
200 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  50.54 
 
 
176 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  38.61 
 
 
176 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  50 
 
 
154 aa  101  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  47.47 
 
 
193 aa  101  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  41.3 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  55.21 
 
 
181 aa  96.3  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  55.79 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  54.64 
 
 
159 aa  95.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  54.64 
 
 
159 aa  95.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  47.06 
 
 
617 aa  93.6  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  55.79 
 
 
184 aa  93.6  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  49.54 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  41.01 
 
 
159 aa  93.2  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  52.63 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  40.85 
 
 
158 aa  92.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  52.63 
 
 
155 aa  92.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  47.87 
 
 
194 aa  92  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  50.54 
 
 
150 aa  91.7  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  42.86 
 
 
149 aa  91.3  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0756  PBP family phospholipid-binding protein  48.98 
 
 
159 aa  90.9  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  44.12 
 
 
206 aa  90.1  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  35.57 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  47.96 
 
 
157 aa  90.5  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  43.16 
 
 
175 aa  88.6  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  43.16 
 
 
175 aa  88.2  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  47.37 
 
 
179 aa  88.2  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  43.43 
 
 
149 aa  87.8  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  39.81 
 
 
155 aa  87.8  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  46.39 
 
 
150 aa  87.8  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  35.92 
 
 
150 aa  87.4  9e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  50.53 
 
 
156 aa  87.4  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0807  PEBP family protein  48.98 
 
 
159 aa  87.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270972  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  43.62 
 
 
149 aa  87  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  47.31 
 
 
159 aa  86.7  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0803  PEBP family protein  47.96 
 
 
159 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  42.55 
 
 
149 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  49.46 
 
 
153 aa  85.9  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  50.53 
 
 
157 aa  84.7  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0898  PEBP family protein  35.21 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  44.09 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  47.42 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  47.96 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0135  YbhB and YbcL  34.31 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  41.67 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7099  PEBP family protein  49.47 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  41.67 
 
 
150 aa  82  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  49 
 
 
158 aa  82  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  37.5 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0960  PEBP family protein  35.21 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0174403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  47.52 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  53 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1038  PEBP family protein  37.74 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  45.74 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  45 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0133  PEBP family protein  35.33 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.372147 
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  40.62 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0343  PEBP family protein  42.57 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  33.09 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  39.29 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1202  PEBP family protein  40 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  46.15 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  39.58 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  42.39 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  39.8 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  42.39 
 
 
150 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  32.59 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1700  PEBP family protein  37.96 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  31.21 
 
 
153 aa  72  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  37.96 
 
 
179 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  37.96 
 
 
179 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  36.61 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  37.96 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  37.96 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1514  PEBP family protein  42 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0212174 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  41.76 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  34.26 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1322  PEBP family protein  44.19 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2718  PEBP family protein  36.3 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1992  PEBP family protein  29.5 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0657  PBP family phospholipid-binding protein  38.98 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0873  PBP family phospholipid-binding protein  34.44 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547082  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  40.57 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3483  PEBP family protein  46.15 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  38.46 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2306  PEBP family protein  32.86 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369465  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1141  PEBP family protein  35.24 
 
 
187 aa  67.4  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1681  PEBP family protein  39.36 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  37.04 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  36.11 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  33.96 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0344  PEBP family protein  35.51 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1321  PEBP family protein  37.37 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  33.96 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3837  YbhB and YbcL  36 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0912  PBP family phospholipid-binding protein  39.47 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0224568  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  33.96 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1917  PEBP family protein  29.92 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.184289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>