271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01998 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  323  8.000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  82.28 
 
 		 159 aa  244  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  82.28 
 
 		 159 aa  244  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  68.55 
 
 		 188 aa  235  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  69.62 
 
 		 156 aa  226  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  64.97 
 
 		 157 aa  226  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  66.88 
 
 		 157 aa  218  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  63.69 
 
 		 179 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  70.89 
 
 		 158 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  65.61 
 
 		 157 aa  194  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  66.67 
 
 		 157 aa  178  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  62.42 
 
 		 191 aa  177  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  62.42 
 
 		 155 aa  177  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  54.19 
 
 		 176 aa  173  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0756  PBP family phospholipid-binding protein  64.78 
 
 		 159 aa  170  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0803  PEBP family protein  64.78 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  52.26 
 
 		 176 aa  165  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0807  PEBP family protein  63.52 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270972  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  52.29 
 
 		 200 aa  152  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  54.9 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  48.43 
 
 		 193 aa  149  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  46.88 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  48.08 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  48.41 
 
 		 175 aa  138  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  48.41 
 
 		 175 aa  138  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  46.79 
 
 		 149 aa  137  6e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  42.86 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  46.79 
 
 		 153 aa  137  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  41.03 
 
 		 194 aa  136  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  45.33 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  43.04 
 
 		 206 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  42.21 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  45.33 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  46.71 
 
 		 149 aa  130  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  43.87 
 
 		 156 aa  130  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  49.38 
 
 		 184 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  42.95 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  42.04 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  42.95 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  40.91 
 
 		 194 aa  121  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  42.24 
 
 		 156 aa  121  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  39.62 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  42.48 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  46.3 
 
 		 183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  41.56 
 
 		 150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  43.51 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  43.36 
 
 		 192 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  35.44 
 
 		 173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  47.13 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  39.87 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  42.21 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  40.38 
 
 		 150 aa  111  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  40.52 
 
 		 153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  45 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  41.51 
 
 		 181 aa  104  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  35.9 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0133  PEBP family protein  41.51 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.372147 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  38.89 
 
 		 617 aa  99.8  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  37.58 
 
 		 179 aa  99  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1681  PEBP family protein  40.25 
 
 		 192 aa  98.6  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  38.99 
 
 		 155 aa  97.4  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3483  PEBP family protein  42.68 
 
 		 149 aa  97.4  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0707  PBP family phospholipid-binding protein  32.52 
 
 		 209 aa  97.4  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.148396 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  39.29 
 
 		 183 aa  97.4  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  39.29 
 
 		 183 aa  97.4  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  38.27 
 
 		 158 aa  97.1  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  37.58 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3837  YbhB and YbcL  34.9 
 
 		 190 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0873  PBP family phospholipid-binding protein  38.04 
 
 		 207 aa  95.9  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547082  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  39.26 
 
 		 184 aa  95.5  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0985  PEBP family protein  38.55 
 
 		 189 aa  95.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340221  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4302  PEBP family protein  34.23 
 
 		 190 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2035  putative kinase inhibitor  38.57 
 
 		 183 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0331  PBP family phospholipid-binding protein  37.38 
 
 		 212 aa  94  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  39.13 
 
 		 182 aa  94  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  39.13 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  37.34 
 
 		 181 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3134  PEBP family protein  36.75 
 
 		 206 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  39.13 
 
 		 182 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0898  PEBP family protein  39.13 
 
 		 190 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  38.41 
 
 		 182 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  38.41 
 
 		 182 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6697  Phospholipid-binding protein-like protein  35.57 
 
 		 192 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.066957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0960  PEBP family protein  37.89 
 
 		 190 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1794  PEBP family protein  39.13 
 
 		 210 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0061  PEBP family protein  37.74 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.758418  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  36.75 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  36.31 
 
 		 159 aa  89  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1202  PEBP family protein  39.58 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  34.51 
 
 		 207 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1789  PBP family phospholipid-binding protein  53 
 
 		 177 aa  88.6  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  36.14 
 
 		 179 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  36.14 
 
 		 179 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0106  PEBP family protein  37.5 
 
 		 203 aa  88.6  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0330816 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  36.14 
 
 		 179 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4277  PEBP family protein  38.75 
 
 		 153 aa  87.8  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  35.71 
 
 		 190 aa  87.4  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4021  PEBP family protein  35.58 
 
 		 180 aa  87.4  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00411793  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0693  PBP family phospholipid-binding protein  35.15 
 
 		 164 aa  87.4  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0102847 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0671  PEBP family protein  35.15 
 
 		 164 aa  87.4  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>