269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0141 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  317  3e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  68.83 
 
 
179 aa  230  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  67.95 
 
 
188 aa  223  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  65.38 
 
 
157 aa  221  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  68.83 
 
 
157 aa  220  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  69.62 
 
 
158 aa  206  7e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  66.03 
 
 
157 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  68.99 
 
 
159 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  66.45 
 
 
157 aa  192  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  64.56 
 
 
159 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  64.56 
 
 
159 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  61.44 
 
 
191 aa  177  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  61.59 
 
 
155 aa  176  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  54.61 
 
 
176 aa  168  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  59.12 
 
 
181 aa  166  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  53.95 
 
 
176 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0803  PEBP family protein  63.46 
 
 
159 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0756  PBP family phospholipid-binding protein  62.82 
 
 
159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  56.67 
 
 
200 aa  161  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  52.26 
 
 
193 aa  161  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0807  PEBP family protein  62.82 
 
 
159 aa  160  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270972  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  46.67 
 
 
155 aa  146  9e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  47.4 
 
 
149 aa  144  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  43.79 
 
 
194 aa  144  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  49.3 
 
 
206 aa  141  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  46.75 
 
 
149 aa  140  7e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  44.67 
 
 
150 aa  138  3e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  42.41 
 
 
185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  46.84 
 
 
157 aa  137  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  45.39 
 
 
175 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  45.39 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  45.39 
 
 
150 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  45.39 
 
 
150 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  48.61 
 
 
192 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  45.39 
 
 
191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  49.06 
 
 
184 aa  131  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  44.23 
 
 
153 aa  130  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  45.22 
 
 
154 aa  130  7.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  46.75 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  43.05 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  47.8 
 
 
183 aa  126  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  46.41 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  46.25 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  42.38 
 
 
153 aa  124  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  43.95 
 
 
150 aa  122  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  47.77 
 
 
158 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  42.48 
 
 
156 aa  120  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  42.86 
 
 
150 aa  120  7e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  40.54 
 
 
149 aa  118  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  42.86 
 
 
150 aa  117  6e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  41.56 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  40.13 
 
 
194 aa  115  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  39.35 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  37.01 
 
 
173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  42.14 
 
 
159 aa  104  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  36.94 
 
 
155 aa  103  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3837  YbhB and YbcL  36.91 
 
 
190 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  37.66 
 
 
181 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  37.8 
 
 
179 aa  102  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4302  PEBP family protein  36.24 
 
 
190 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  37.33 
 
 
153 aa  100  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  40.74 
 
 
156 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  40.91 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  37.89 
 
 
617 aa  98.6  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3483  PEBP family protein  42.67 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6697  Phospholipid-binding protein-like protein  36.91 
 
 
192 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.066957  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  40.96 
 
 
180 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0898  PEBP family protein  38.36 
 
 
190 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  36.55 
 
 
182 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  36.55 
 
 
182 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  36.55 
 
 
182 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  35.86 
 
 
182 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  37.34 
 
 
159 aa  94  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  37.32 
 
 
183 aa  94  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  35.86 
 
 
182 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  37.32 
 
 
183 aa  94  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  36.49 
 
 
182 aa  94  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2035  putative kinase inhibitor  37.32 
 
 
183 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  37.11 
 
 
190 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  35.92 
 
 
190 aa  92.8  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0873  PBP family phospholipid-binding protein  37.34 
 
 
207 aa  92  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547082  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  36.69 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0133  PEBP family protein  38.75 
 
 
190 aa  92  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.372147 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  33.76 
 
 
181 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1202  PEBP family protein  37.18 
 
 
155 aa  90.9  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  36.49 
 
 
182 aa  90.5  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0279  PBP family phospholipid-binding protein  34.76 
 
 
200 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1700  PEBP family protein  36.71 
 
 
185 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  32.93 
 
 
179 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  32.93 
 
 
179 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  32.93 
 
 
179 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  34.9 
 
 
181 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  32.93 
 
 
179 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  36.42 
 
 
185 aa  88.6  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0960  PEBP family protein  35.85 
 
 
190 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0174403 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0331  PBP family phospholipid-binding protein  34.16 
 
 
212 aa  88.2  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1789  PBP family phospholipid-binding protein  50.53 
 
 
177 aa  87.8  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  38.27 
 
 
187 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2400  PEBP family protein  34.46 
 
 
190 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  38.27 
 
 
187 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>