242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0873 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0873  PBP family phospholipid-binding protein  100 
 
 		 207 aa  402  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547082  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0898  PEBP family protein  50 
 
 		 190 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1794  PEBP family protein  50.26 
 
 		 210 aa  167  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  46.35 
 
 		 190 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0960  PEBP family protein  46.35 
 
 		 190 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0133  PEBP family protein  45.55 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.372147 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  41.56 
 
 		 176 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  45.51 
 
 		 181 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  39.52 
 
 		 176 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0887  PEBP family protein  35.26 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  38.42 
 
 		 617 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1038  PEBP family protein  40.54 
 
 		 187 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  36.08 
 
 		 193 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  36.25 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  34.62 
 
 		 175 aa  99.8  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  39.19 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  38.12 
 
 		 153 aa  99  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  34.84 
 
 		 156 aa  99  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  34.62 
 
 		 175 aa  98.6  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  36.31 
 
 		 154 aa  98.2  7e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  36.42 
 
 		 157 aa  97.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  36.77 
 
 		 181 aa  95.9  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  38.99 
 
 		 153 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  37.74 
 
 		 158 aa  94  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  36.13 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  35.48 
 
 		 191 aa  94  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  40 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  32.9 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  36.48 
 
 		 159 aa  92.4  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1567  PEBP family protein  39.74 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.627481 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  37.34 
 
 		 156 aa  92  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  32.7 
 
 		 194 aa  91.7  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  40.12 
 
 		 155 aa  91.7  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  39.07 
 
 		 150 aa  91.7  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  37.58 
 
 		 153 aa  91.3  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  35.67 
 
 		 157 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32114  predicted protein  33.82 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.223556  normal  0.54599 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  33.54 
 
 		 179 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  34.84 
 
 		 156 aa  89.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  35.44 
 
 		 158 aa  89.7  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  32.1 
 
 		 150 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  32.1 
 
 		 150 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6091  PEBP family protein  39.63 
 
 		 174 aa  88.2  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.119084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  35.2 
 
 		 188 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  39.19 
 
 		 155 aa  87.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  36.42 
 
 		 150 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  32.28 
 
 		 150 aa  87  2e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  37.75 
 
 		 150 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  36.48 
 
 		 153 aa  87  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  35.9 
 
 		 150 aa  87  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  35.03 
 
 		 156 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  33.77 
 
 		 155 aa  85.1  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  37.89 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  35.9 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  38.46 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  35.85 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  30.63 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  33.33 
 
 		 157 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  37.11 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0061  PEBP family protein  54.05 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.758418  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  40.37 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  37.16 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  40.37 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  36.26 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  33.74 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  33.94 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  33.94 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  31.58 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  32.89 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3483  PEBP family protein  35.67 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3733  PBP family phospholipid-binding protein  32.52 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2903  PEBP family protein  31.71 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4021  PEBP family protein  30.57 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00411793  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11940  lipoprotein lppC  37.8 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0280  PBP family phospholipid-binding protein  33.53 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11939  hypothetical protein  35.71 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2489  PEBP family protein  33.74 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.182632 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1950  PBP family phospholipid-binding protein  32.9 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.141097  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  36.75 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4277  PEBP family protein  33.77 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246525  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  31.58 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  35.22 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  34.36 
 
 		 180 aa  72  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  31.29 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2643  PEBP family protein  35.62 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3081  PEBP family protein  35.62 
 
 		 158 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  31.29 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  31.29 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  32.32 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2785  PEBP family protein  35 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252116  normal  0.340055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  32.32 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  32.92 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  30.67 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2718  PEBP family protein  37.96 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38600  phospholipid-binding protein, PBP family  35.4 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1141  PEBP family protein  44.66 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001407  phospholipid-binding protein  31.32 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0316  phosphatidylethanolamine-binding protein  31.9 
 
 		 159 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0634  PEBP family protein  29.25 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.731685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  28.92 
 
 		 173 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>