266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4200 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2903  PEBP family protein  56.97 
 
 		 188 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3733  PBP family phospholipid-binding protein  49.38 
 
 		 184 aa  154  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2643  PEBP family protein  44.38 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7099  PEBP family protein  49.03 
 
 		 189 aa  134  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3081  PEBP family protein  43.75 
 
 		 158 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2489  PEBP family protein  40.96 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.182632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0182  PBP family phospholipid-binding protein  43.9 
 
 		 186 aa  131  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2785  PEBP family protein  39.89 
 
 		 183 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252116  normal  0.340055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  37.91 
 
 		 183 aa  107  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  38.73 
 
 		 184 aa  107  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  39.47 
 
 		 179 aa  98.6  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  36.31 
 
 		 155 aa  97.4  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  37.2 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  35.56 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1038  PEBP family protein  35.33 
 
 		 187 aa  95.9  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4277  PEBP family protein  36.02 
 
 		 153 aa  94.4  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1246  PEBP family protein  34.66 
 
 		 175 aa  94  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  38.46 
 
 		 150 aa  94  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  38.18 
 
 		 157 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  39.61 
 
 		 153 aa  93.6  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  35 
 
 		 154 aa  91.7  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  36.14 
 
 		 191 aa  91.3  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  37.68 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  36.81 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  37.43 
 
 		 617 aa  90.9  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  33.76 
 
 		 149 aa  89.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  36.36 
 
 		 157 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  34.39 
 
 		 149 aa  88.6  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  38.13 
 
 		 157 aa  88.2  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  35.48 
 
 		 175 aa  88.2  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  35.48 
 
 		 175 aa  87.8  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  40.58 
 
 		 200 aa  87.8  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  34.16 
 
 		 156 aa  87.8  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  37.18 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  38.27 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1917  PEBP family protein  32.74 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.184289 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  37.33 
 
 		 153 aa  86.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  32.14 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  39.06 
 
 		 206 aa  85.9  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  39.84 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  38.13 
 
 		 150 aa  85.9  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  33.12 
 
 		 156 aa  85.1  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  40.14 
 
 		 179 aa  84.7  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  35.26 
 
 		 150 aa  84.7  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  39.06 
 
 		 179 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  39.06 
 
 		 179 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  35.53 
 
 		 176 aa  84.3  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  34.62 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  37.8 
 
 		 159 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  37.8 
 
 		 159 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  31.65 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  35.22 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  31.22 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  32.52 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  40.32 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  37.5 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8369  PEBP family protein  34.25 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  43.52 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11940  lipoprotein lppC  41.3 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  36.23 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  28.81 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  34.59 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  38.57 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  32.93 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  34.59 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  33.33 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0594  hypothetical protein  37.27 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  41.27 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1202  PEBP family protein  36.54 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  37.31 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4302  PEBP family protein  33.14 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0898  PEBP family protein  37.58 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  40.37 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00740  predicted kinase inhibitor  34.85 
 
 		 158 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0173432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2869  PEBP family protein  34.85 
 
 		 158 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  40.37 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00757  hypothetical protein  34.85 
 
 		 158 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259899  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  33.53 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2870  putative kinase inhibitor protein  34.85 
 
 		 158 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0113599  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0871  PEBP family protein  42.11 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.393701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  37.6 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  33.1 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3837  YbhB and YbcL  33.14 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2035  putative kinase inhibitor  40.37 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0827  putative kinase inhibitor protein  34.85 
 
 		 158 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000771777  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0836  putative kinase inhibitor protein  34.85 
 
 		 158 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.145482  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2579  putative kinase inhibitor protein  34.85 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0939329  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3314  PEBP family protein  33.97 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0671  PEBP family protein  30.72 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636068  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1447  PEBP family protein  36.84 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  34.18 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0693  PBP family phospholipid-binding protein  30.72 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0102847 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0873  PBP family phospholipid-binding protein  33.94 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547082  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0921  putative kinase inhibitor protein  34.85 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0960  PEBP family protein  35.44 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  36.72 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0796  putative kinase inhibitor protein  34.09 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0510178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  34.95 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>