268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4072 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  100 
 
 
183 aa  370  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  80.9 
 
 
184 aa  289  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  54.61 
 
 
154 aa  157  7e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  44.32 
 
 
173 aa  155  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  43.3 
 
 
200 aa  150  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  46.2 
 
 
193 aa  149  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  49.67 
 
 
149 aa  146  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  48.67 
 
 
150 aa  144  9e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  48.34 
 
 
149 aa  142  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  40.41 
 
 
194 aa  142  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  38.83 
 
 
185 aa  141  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  42.37 
 
 
176 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  52.67 
 
 
181 aa  135  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  46.1 
 
 
155 aa  135  5e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  40.98 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  40.98 
 
 
175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  51.28 
 
 
191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  47.53 
 
 
188 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  51.61 
 
 
155 aa  131  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  44.3 
 
 
156 aa  131  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  42.11 
 
 
176 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  44.87 
 
 
157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  49.65 
 
 
206 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  48 
 
 
153 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  47.8 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  44.1 
 
 
179 aa  125  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  51.05 
 
 
149 aa  125  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  45.1 
 
 
150 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  44.3 
 
 
157 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  45.1 
 
 
150 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1488  PEBP family protein  41.67 
 
 
169 aa  124  7e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  41.33 
 
 
149 aa  122  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  35.53 
 
 
194 aa  118  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  49.07 
 
 
159 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  49.07 
 
 
159 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  46.26 
 
 
191 aa  115  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  41.36 
 
 
157 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  41.03 
 
 
156 aa  115  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  43.54 
 
 
181 aa  114  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  39.87 
 
 
158 aa  114  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  42.14 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  49.65 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  43.05 
 
 
150 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  46.3 
 
 
157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  43.67 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  49.37 
 
 
157 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  39.47 
 
 
150 aa  108  5e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  38.69 
 
 
179 aa  108  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  37.91 
 
 
187 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4277  PEBP family protein  41.06 
 
 
153 aa  107  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246525  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  37.91 
 
 
187 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  42.11 
 
 
156 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  40.82 
 
 
149 aa  105  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  41.06 
 
 
617 aa  104  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  41.5 
 
 
153 aa  104  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  44.72 
 
 
158 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  42.18 
 
 
153 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4884  hypothetical protein  37.2 
 
 
186 aa  102  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  36.54 
 
 
159 aa  102  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1700  PEBP family protein  40.12 
 
 
185 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3733  PBP family phospholipid-binding protein  37.97 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0756  PBP family phospholipid-binding protein  41.36 
 
 
159 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  39.05 
 
 
207 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  44.58 
 
 
159 aa  99.4  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2903  PEBP family protein  36.25 
 
 
188 aa  99  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1992  PEBP family protein  33.33 
 
 
180 aa  98.6  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0803  PEBP family protein  40.74 
 
 
159 aa  97.8  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1789  PBP family phospholipid-binding protein  55.79 
 
 
177 aa  97.1  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  34.16 
 
 
184 aa  96.3  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  35.71 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  35.76 
 
 
182 aa  95.9  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0594  hypothetical protein  37.25 
 
 
180 aa  95.5  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  42.95 
 
 
150 aa  95.1  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0033  PBP family phospholipid-binding protein  37.74 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1141  PEBP family protein  36.53 
 
 
167 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06342  hypothetical protein  35.03 
 
 
177 aa  94.7  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0807  PEBP family protein  40.74 
 
 
159 aa  94.4  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270972  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  41.61 
 
 
150 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0904  hypothetical protein  35.88 
 
 
167 aa  92.8  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0858  PEBP family protein  37.27 
 
 
174 aa  92.8  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11940  lipoprotein lppC  37.67 
 
 
201 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3014  hypothetical protein  35.88 
 
 
170 aa  91.3  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1269  hypothetical protein  35.88 
 
 
170 aa  91.3  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0969  hypothetical protein  35.88 
 
 
170 aa  91.3  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3037  hypothetical protein  35.88 
 
 
170 aa  91.3  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930194  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1108  hypothetical protein  35.88 
 
 
170 aa  91.3  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1114  phosphatidylethanolamine-binding protein  35.88 
 
 
170 aa  91.3  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  32.78 
 
 
181 aa  91.3  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0061  PEBP family protein  40.26 
 
 
154 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.758418  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0912  PBP family phospholipid-binding protein  41.29 
 
 
178 aa  90.9  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0224568  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  31.09 
 
 
190 aa  90.9  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0871  PEBP family protein  33.97 
 
 
177 aa  90.1  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.393701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2785  PEBP family protein  36.46 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252116  normal  0.340055 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2615  YbhB and YbcL  35.63 
 
 
247 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3372  PBP family phospholipid-binding protein  36.69 
 
 
167 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00311199  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  35.22 
 
 
182 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001407  phospholipid-binding protein  35.4 
 
 
177 aa  90.1  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0019  PEBP family protein  36.88 
 
 
180 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3163  PBP family phospholipid-binding protein  34.36 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.650541  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0280  PBP family phospholipid-binding protein  34.59 
 
 
182 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>