274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3959 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  100 
 
 		 153 aa  318  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  93.46 
 
 		 153 aa  300  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  56.25 
 
 		 176 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  54.86 
 
 		 176 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  53.33 
 
 		 153 aa  167  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  50.34 
 
 		 194 aa  149  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  49.32 
 
 		 191 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  50.71 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  47.55 
 
 		 156 aa  144  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  51.43 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  49.32 
 
 		 200 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  45.89 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  48.3 
 
 		 181 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  46.98 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  47.33 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  47.62 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  45.95 
 
 		 154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  46.94 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  44.9 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  44.44 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  44.44 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  42.31 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  44.9 
 
 		 175 aa  130  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  44.59 
 
 		 179 aa  130  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  43.05 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  43.92 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  45.95 
 
 		 188 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  45.89 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  45.16 
 
 		 206 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  45.45 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  45.45 
 
 		 191 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  46 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  46 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  47.33 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  40.67 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  44.14 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  45.33 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  42.25 
 
 		 184 aa  111  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  39.47 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  42.18 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  41.29 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  42.58 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  40.41 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  42.86 
 
 		 192 aa  106  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  39.62 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11940  lipoprotein lppC  44.17 
 
 		 201 aa  104  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4021  PEBP family protein  41.22 
 
 		 180 aa  104  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00411793  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  38.67 
 
 		 190 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  42.18 
 
 		 183 aa  103  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0960  PEBP family protein  38.67 
 
 		 190 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174403 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  39.86 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  44.9 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  43.54 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11939  hypothetical protein  44.44 
 
 		 204 aa  100  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0133  PEBP family protein  38.56 
 
 		 190 aa  100  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.372147 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  42.95 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0898  PEBP family protein  36.13 
 
 		 190 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  36.91 
 
 		 153 aa  98.6  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3483  PEBP family protein  42.18 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1321  PEBP family protein  41.98 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1794  PEBP family protein  38.27 
 
 		 210 aa  97.1  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  37.97 
 
 		 617 aa  96.7  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  43.44 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0887  PEBP family protein  36.48 
 
 		 190 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1202  PEBP family protein  40.79 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  36.62 
 
 		 182 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0873  PBP family phospholipid-binding protein  38.99 
 
 		 207 aa  94.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547082  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  39.61 
 
 		 187 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  39.61 
 
 		 187 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  36.62 
 
 		 182 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0280  PBP family phospholipid-binding protein  35.92 
 
 		 182 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0756  PBP family phospholipid-binding protein  40 
 
 		 159 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  42.86 
 
 		 158 aa  91.3  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  37.67 
 
 		 150 aa  91.3  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  35.26 
 
 		 179 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  35.26 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  37.01 
 
 		 194 aa  89.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  35.26 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6697  Phospholipid-binding protein-like protein  39.01 
 
 		 192 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.066957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  35.26 
 
 		 184 aa  89.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1038  PEBP family protein  38.56 
 
 		 187 aa  89  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1681  PEBP family protein  34 
 
 		 192 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  39.04 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2306  PEBP family protein  35.81 
 
 		 169 aa  88.6  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369465  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0856  putative kinase inhibitor protein  36.71 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.524056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0919  putative kinase inhibitor protein  36.71 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3229  PBP family phospholipid-binding protein  37.24 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0828  putative kinase inhibitor protein  36.71 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.354915  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0887  putative kinase inhibitor protein  36.71 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4277  PEBP family protein  40 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  39.69 
 
 		 182 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2903  PEBP family protein  37.42 
 
 		 188 aa  87.8  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  39.69 
 
 		 182 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  39.69 
 
 		 182 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0803  PEBP family protein  40 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  39.69 
 
 		 182 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0316  phosphatidylethanolamine-binding protein  36.17 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  33.97 
 
 		 179 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  39.69 
 
 		 182 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>