273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3871 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  100 
 
 		 153 aa  319  8e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  93.46 
 
 		 153 aa  300  6.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  53.47 
 
 		 176 aa  173  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  53.47 
 
 		 176 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  52.67 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  48.98 
 
 		 191 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  46.58 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  47.62 
 
 		 194 aa  141  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  49.29 
 
 		 149 aa  140  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  46.85 
 
 		 156 aa  140  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  47.97 
 
 		 200 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  46.53 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  46.31 
 
 		 193 aa  135  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  46.85 
 
 		 181 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  46.98 
 
 		 150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  46.31 
 
 		 150 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  46 
 
 		 156 aa  130  5e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  42.48 
 
 		 185 aa  129  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  43.54 
 
 		 175 aa  127  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  44.59 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  40.38 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  44.37 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  43.92 
 
 		 179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  42.38 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  45.45 
 
 		 191 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  45.45 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  45.27 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  43.15 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  45.21 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  43.23 
 
 		 206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  41.33 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  45.33 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  43.45 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  45.33 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  40.79 
 
 		 173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  46 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  45.33 
 
 		 159 aa  110  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  41.55 
 
 		 184 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  41.5 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  40.14 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  41.72 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  42.58 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  41.5 
 
 		 183 aa  104  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  46.02 
 
 		 192 aa  103  6e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  38.99 
 
 		 179 aa  103  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11940  lipoprotein lppC  45 
 
 		 201 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  39.13 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4021  PEBP family protein  39.86 
 
 		 180 aa  100  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00411793  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1321  PEBP family protein  41.98 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  37.33 
 
 		 190 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11939  hypothetical protein  41.38 
 
 		 204 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0856  putative kinase inhibitor protein  39.24 
 
 		 158 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.524056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0887  putative kinase inhibitor protein  39.24 
 
 		 158 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0828  putative kinase inhibitor protein  39.24 
 
 		 158 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.354915  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0919  putative kinase inhibitor protein  39.24 
 
 		 158 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  43.62 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  43.62 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  35.57 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  42.28 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3483  PEBP family protein  40.82 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  37.32 
 
 		 182 aa  95.5  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  37.32 
 
 		 182 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0942  putative kinase inhibitor protein  38.61 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  36.54 
 
 		 184 aa  94.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1202  PEBP family protein  40.79 
 
 		 155 aa  94.4  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0280  PBP family phospholipid-binding protein  36.62 
 
 		 182 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0960  PEBP family protein  36.67 
 
 		 190 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0887  PEBP family protein  36.48 
 
 		 190 aa  92.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6697  Phospholipid-binding protein-like protein  40.43 
 
 		 192 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.066957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1794  PEBP family protein  37.04 
 
 		 210 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  41.8 
 
 		 159 aa  92  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  36.54 
 
 		 179 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  36.54 
 
 		 179 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0133  PEBP family protein  36.6 
 
 		 190 aa  92  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.372147 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  36.54 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0921  putative kinase inhibitor protein  37.97 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2579  putative kinase inhibitor protein  37.97 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0939329  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0796  putative kinase inhibitor protein  37.97 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0510178  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00740  predicted kinase inhibitor  37.34 
 
 		 158 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0173432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2869  PEBP family protein  37.34 
 
 		 158 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2870  putative kinase inhibitor protein  37.34 
 
 		 158 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0113599  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  37.67 
 
 		 150 aa  91.3  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0827  putative kinase inhibitor protein  37.34 
 
 		 158 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000771777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00757  hypothetical protein  37.34 
 
 		 158 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259899  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0836  putative kinase inhibitor protein  37.34 
 
 		 158 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.145482  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  36.08 
 
 		 617 aa  90.9  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4277  PEBP family protein  38.78 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3837  YbhB and YbcL  35.77 
 
 		 190 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0898  PEBP family protein  34.19 
 
 		 190 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1681  PEBP family protein  34 
 
 		 192 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0316  phosphatidylethanolamine-binding protein  36.88 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  41.22 
 
 		 181 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  35.26 
 
 		 179 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1597  PEBP family protein  37.41 
 
 		 183 aa  88.2  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0756  PBP family phospholipid-binding protein  40.41 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  39.69 
 
 		 182 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  39.69 
 
 		 182 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4302  PEBP family protein  35.77 
 
 		 190 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>