261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0508 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  100 
 
 
150 aa  311  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  87.33 
 
 
150 aa  279  1e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  84.67 
 
 
150 aa  270  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  43.05 
 
 
185 aa  136  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  44.44 
 
 
181 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  40.94 
 
 
193 aa  126  9.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  43.51 
 
 
179 aa  122  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  39.6 
 
 
157 aa  121  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  42.86 
 
 
156 aa  120  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  41.3 
 
 
206 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  43.33 
 
 
156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  39.33 
 
 
154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  40.85 
 
 
200 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  43.71 
 
 
149 aa  114  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  42.18 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  40.69 
 
 
149 aa  110  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  38.31 
 
 
157 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  39.61 
 
 
191 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  39.35 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  41.72 
 
 
156 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  41.29 
 
 
158 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  38.31 
 
 
150 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  38.31 
 
 
150 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  38.31 
 
 
188 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  39.07 
 
 
150 aa  103  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  40.54 
 
 
153 aa  103  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  41.73 
 
 
192 aa  103  8e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  37.34 
 
 
150 aa  103  9e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  40.26 
 
 
159 aa  102  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  40.14 
 
 
175 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  39.07 
 
 
181 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  37.41 
 
 
176 aa  102  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  40.14 
 
 
175 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  37.25 
 
 
149 aa  102  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  38.96 
 
 
159 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  38.26 
 
 
155 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  38.96 
 
 
159 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  37.41 
 
 
194 aa  101  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  35.71 
 
 
157 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  39.61 
 
 
158 aa  100  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  38.26 
 
 
617 aa  100  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  42.95 
 
 
153 aa  100  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  40.91 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  39.19 
 
 
191 aa  98.6  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  35.33 
 
 
173 aa  98.2  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  41.72 
 
 
149 aa  96.7  9e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  43.62 
 
 
153 aa  96.7  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  36.73 
 
 
176 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  34.84 
 
 
158 aa  95.5  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  34.64 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  38.26 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0807  PEBP family protein  35.06 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270972  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0803  PEBP family protein  35.06 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3483  PEBP family protein  38.93 
 
 
149 aa  90.9  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  38.26 
 
 
184 aa  90.5  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4021  PEBP family protein  33.77 
 
 
180 aa  89.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00411793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  39.6 
 
 
183 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1321  PEBP family protein  36.64 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0873  PBP family phospholipid-binding protein  36.42 
 
 
207 aa  87.8  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547082  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4277  PEBP family protein  37.58 
 
 
153 aa  87.8  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246525  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1038  PEBP family protein  35.95 
 
 
187 aa  87.4  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  38 
 
 
150 aa  87.8  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3229  PBP family phospholipid-binding protein  36.49 
 
 
153 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0756  PBP family phospholipid-binding protein  37.66 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  37.01 
 
 
157 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6829  PEBP family protein  30.54 
 
 
212 aa  84.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0135  YbhB and YbcL  33.33 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  35.26 
 
 
187 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  35.26 
 
 
187 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  32.69 
 
 
159 aa  84.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0061  PEBP family protein  38.93 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.758418  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1789  PBP family phospholipid-binding protein  41.67 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3733  PBP family phospholipid-binding protein  34.18 
 
 
184 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  31.61 
 
 
194 aa  80.5  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3014  hypothetical protein  36.81 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1269  hypothetical protein  36.81 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1514  PEBP family protein  35.46 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0212174 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0969  hypothetical protein  36.81 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3037  hypothetical protein  36.81 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930194  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1108  hypothetical protein  36.81 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1114  phosphatidylethanolamine-binding protein  36.81 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1558  hypothetical protein  36.81 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  34.87 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  34.04 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1141  PEBP family protein  37.06 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  34.04 
 
 
182 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3372  PBP family phospholipid-binding protein  37.76 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00311199  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1202  PEBP family protein  34.42 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  34.04 
 
 
182 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1141  PEBP family protein  33.1 
 
 
187 aa  77  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  34.04 
 
 
182 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0921  putative kinase inhibitor protein  37.3 
 
 
158 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168155  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2579  putative kinase inhibitor protein  37.3 
 
 
158 aa  77  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0939329  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  34.04 
 
 
182 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2869  PEBP family protein  37.3 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1322  PEBP family protein  36.23 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0796  putative kinase inhibitor protein  37.3 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0510178  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  31.01 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2903  PEBP family protein  34.18 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>