224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1794 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1794  PEBP family protein  100 
 
 		 210 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0133  PEBP family protein  52.6 
 
 		 190 aa  180  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.372147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  48.69 
 
 		 190 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0960  PEBP family protein  48.69 
 
 		 190 aa  169  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0898  PEBP family protein  48.7 
 
 		 190 aa  169  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0873  PBP family phospholipid-binding protein  50.26 
 
 		 207 aa  167  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547082  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0887  PEBP family protein  38.86 
 
 		 190 aa  138  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1567  PEBP family protein  48.08 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.627481 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1038  PEBP family protein  40.74 
 
 		 187 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  38.27 
 
 		 153 aa  97.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  34.81 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  39.51 
 
 		 181 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  35.03 
 
 		 181 aa  95.9  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  37.42 
 
 		 617 aa  95.1  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  37.5 
 
 		 155 aa  94.4  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  33.54 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32114  predicted protein  32.35 
 
 		 201 aa  94.7  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.223556  normal  0.54599 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  37.04 
 
 		 153 aa  92.8  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  36.02 
 
 		 157 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  32.5 
 
 		 176 aa  91.7  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  32.5 
 
 		 176 aa  89.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  36.2 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  33.33 
 
 		 157 aa  86.3  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  36.02 
 
 		 155 aa  85.9  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  38.36 
 
 		 188 aa  85.1  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  29.49 
 
 		 156 aa  84.7  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  35.44 
 
 		 153 aa  84.7  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  31.52 
 
 		 156 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  35.62 
 
 		 156 aa  84  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  36 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  35.22 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  33.33 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  37.25 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  32.26 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  33.12 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  40 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  40 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4277  PEBP family protein  33.12 
 
 		 153 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  37.58 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  36.42 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6091  PEBP family protein  36.23 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.119084 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  31.65 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11939  hypothetical protein  35.71 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  33.77 
 
 		 150 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  32.87 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  35.44 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  33.77 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  32.7 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  31.93 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  32.9 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3733  PBP family phospholipid-binding protein  31.71 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  29.81 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  26.95 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  32.73 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  32.73 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  33.77 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  34.78 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1950  PBP family phospholipid-binding protein  35.57 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.141097  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  31.45 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  31.45 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  32.03 
 
 		 175 aa  72  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  39.13 
 
 		 159 aa  72  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  32.03 
 
 		 175 aa  71.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1681  PEBP family protein  28.48 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  26.23 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  27.11 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2489  PEBP family protein  32.93 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.182632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0061  PEBP family protein  37.74 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.758418  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  33.76 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  34.78 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11940  lipoprotein lppC  36.67 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2290  PEBP family protein  38.52 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  31.79 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  31.79 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2903  PEBP family protein  30.72 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0803  PEBP family protein  38.99 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04720  phospholipid-binding protein, PBP family  34.68 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.583132  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  27.39 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  25.75 
 
 		 159 aa  64.3  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0807  PEBP family protein  38.36 
 
 		 159 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270972  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  31.25 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0756  PBP family phospholipid-binding protein  37.74 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  33.87 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  33.13 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2306  PEBP family protein  31.21 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369465  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6791  Phospholipid-binding protein-like protein  27.52 
 
 		 188 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.441972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3134  PEBP family protein  35.07 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0671  PEBP family protein  34.46 
 
 		 164 aa  62  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636068  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0693  PBP family phospholipid-binding protein  34.46 
 
 		 164 aa  62  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0102847 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7099  PEBP family protein  32.67 
 
 		 189 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12170  hypothetical protein  29.65 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.662377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2785  PEBP family protein  31.29 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252116  normal  0.340055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  31.88 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10998  conserved hypothetical protein  30.2 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5877  PEBP family protein  32.79 
 
 		 175 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0985  PEBP family protein  35.16 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340221  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3081  PEBP family protein  31.68 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  28.09 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>