216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1567 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1567  PEBP family protein  100 
 
 
195 aa  388  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.627481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0887  PEBP family protein  45.08 
 
 
190 aa  149  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1794  PEBP family protein  48.08 
 
 
210 aa  138  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0898  PEBP family protein  46.25 
 
 
190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0133  PEBP family protein  45.96 
 
 
190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.372147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0960  PEBP family protein  41.41 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0174403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  41.41 
 
 
190 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0873  PBP family phospholipid-binding protein  39.74 
 
 
207 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547082  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1038  PEBP family protein  34.5 
 
 
187 aa  88.2  7e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  35.14 
 
 
150 aa  88.2  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  35.14 
 
 
150 aa  86.3  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  35.71 
 
 
617 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  35.14 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  32.5 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  31.52 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  32.48 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  32.92 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1681  PEBP family protein  32.32 
 
 
192 aa  79  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  31.17 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6091  PEBP family protein  33.33 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.119084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  32.72 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  29.11 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  28.75 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  33.57 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2615  YbhB and YbcL  31.29 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  31.61 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  30.49 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  27.56 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  32.48 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  27.92 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  33.76 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  32.48 
 
 
153 aa  72  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  30.06 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  29.49 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  27.93 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  29.49 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04720  phospholipid-binding protein, PBP family  32.32 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.583132  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  31.25 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32114  predicted protein  31.82 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.223556  normal  0.54599 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  28.03 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3229  PBP family phospholipid-binding protein  29.75 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4277  PEBP family protein  35.54 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246525  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  30.63 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  33.33 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  30.63 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  30.63 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  30.63 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  31.87 
 
 
150 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  33.77 
 
 
156 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  27.88 
 
 
156 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  26.83 
 
 
158 aa  67  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0280  PBP family phospholipid-binding protein  30.22 
 
 
182 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  31.01 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  28.85 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5877  PEBP family protein  29.81 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1950  PBP family phospholipid-binding protein  31.41 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.141097  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  28.66 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  33.76 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  31.45 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0634  PEBP family protein  29.17 
 
 
268 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.731685  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0606  PEBP family protein  29.17 
 
 
268 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.839028  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  29.87 
 
 
191 aa  64.3  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  27.04 
 
 
159 aa  63.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  27.85 
 
 
150 aa  63.2  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38600  phospholipid-binding protein, PBP family  31.71 
 
 
182 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  26.42 
 
 
159 aa  63.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  32.24 
 
 
150 aa  63.5  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1992  PEBP family protein  27.54 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  29.11 
 
 
191 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  29.14 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11939  hypothetical protein  32.53 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  29.11 
 
 
155 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  34.23 
 
 
187 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  34.23 
 
 
187 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2196  PEBP family protein  32.1 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00567412  hitchhiker  0.00102935 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  30 
 
 
150 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0671  PEBP family protein  31.97 
 
 
164 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636068  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  26.45 
 
 
149 aa  62.4  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  29.11 
 
 
200 aa  62.4  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  27.01 
 
 
182 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1202  PEBP family protein  32.1 
 
 
155 aa  62.4  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  28.57 
 
 
149 aa  62.4  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0693  PBP family phospholipid-binding protein  31.97 
 
 
164 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0102847 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  29.19 
 
 
158 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2785  PEBP family protein  28.26 
 
 
183 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252116  normal  0.340055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0182  PBP family phospholipid-binding protein  32.52 
 
 
186 aa  62  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333114  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  26.62 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  29.03 
 
 
184 aa  62  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  27.54 
 
 
194 aa  61.6  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3314  PEBP family protein  32.14 
 
 
179 aa  62  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2306  PEBP family protein  30.63 
 
 
169 aa  61.6  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369465  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1308  putative kinase inhibitor protein  31.75 
 
 
160 aa  61.2  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  29.68 
 
 
153 aa  60.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  26.28 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  29.38 
 
 
150 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3038  PEBP family protein  30.36 
 
 
178 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  28.85 
 
 
153 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8937  PEBP family protein  30.36 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.995518  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0316  phosphatidylethanolamine-binding protein  28.06 
 
 
159 aa  60.1  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2774  PBP family phospholipid-binding protein  28.66 
 
 
169 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.504548  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>