266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3676 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  100 
 
 
156 aa  315  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0061  PEBP family protein  78.95 
 
 
154 aa  228  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.758418  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4277  PEBP family protein  46.71 
 
 
153 aa  140  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246525  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  42.28 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  38.71 
 
 
175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  38.71 
 
 
175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  40.51 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  42.76 
 
 
184 aa  107  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  38.85 
 
 
194 aa  106  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  42.11 
 
 
183 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  38.82 
 
 
193 aa  104  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  40.4 
 
 
181 aa  104  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  39.75 
 
 
188 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  39.75 
 
 
179 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  39.88 
 
 
617 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1488  PEBP family protein  39.22 
 
 
169 aa  101  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  37.33 
 
 
176 aa  101  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  37.11 
 
 
157 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  40.74 
 
 
156 aa  99  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  38.96 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  37.93 
 
 
200 aa  98.2  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  41.4 
 
 
159 aa  97.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  41.4 
 
 
159 aa  97.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  43.59 
 
 
191 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  39.49 
 
 
158 aa  95.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  43.23 
 
 
155 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  38.26 
 
 
150 aa  94.7  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  38.26 
 
 
150 aa  94  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  32.69 
 
 
185 aa  94  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  36.54 
 
 
150 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  35.85 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  36.54 
 
 
150 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  37.18 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  35.48 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  37.33 
 
 
150 aa  92.8  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  34.06 
 
 
182 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  34.06 
 
 
182 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  33.11 
 
 
173 aa  92  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  34.67 
 
 
176 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  34.06 
 
 
182 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  39.47 
 
 
190 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  34.06 
 
 
182 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  36.08 
 
 
185 aa  91.7  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  38.78 
 
 
181 aa  91.3  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  34.23 
 
 
150 aa  91.7  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  37.58 
 
 
150 aa  91.3  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  33.54 
 
 
157 aa  90.5  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  36.54 
 
 
149 aa  90.1  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  36.71 
 
 
158 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  35.22 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21340  phospholipid-binding protein, PBP family  38.31 
 
 
176 aa  89  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437018  normal  0.157291 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  32.08 
 
 
184 aa  89  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12230  conserved hypothetical protein TIGR00481  39.74 
 
 
161 aa  89  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.888512  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3483  PEBP family protein  38.71 
 
 
149 aa  88.2  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  38.26 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.942743 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  38.76 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  41.83 
 
 
157 aa  87  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  34.19 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  35.97 
 
 
181 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  32.91 
 
 
194 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  34 
 
 
181 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3229  PBP family phospholipid-binding protein  38.51 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2035  putative kinase inhibitor  33.74 
 
 
183 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0960  PEBP family protein  38.16 
 
 
190 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0174403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0873  PBP family phospholipid-binding protein  35.03 
 
 
207 aa  86.3  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547082  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  33.55 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  37.67 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2590  PEBP family protein  33.12 
 
 
165 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1308  putative kinase inhibitor protein  37.04 
 
 
160 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3516  PEBP family protein  33.12 
 
 
165 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0898  PEBP family protein  37.09 
 
 
190 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  34.18 
 
 
158 aa  84.3  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0331  PBP family phospholipid-binding protein  33.99 
 
 
212 aa  84.3  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  33.13 
 
 
183 aa  84  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  33.13 
 
 
183 aa  84  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1618  PEBP family protein  37.09 
 
 
171 aa  84  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.82166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  37.25 
 
 
153 aa  84  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  38.1 
 
 
153 aa  83.6  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  33.12 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2196  PEBP family protein  37.82 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00567412  hitchhiker  0.00102935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0133  PEBP family protein  36.6 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.372147 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00740  predicted kinase inhibitor  33.97 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0173432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2869  PEBP family protein  33.97 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0827  putative kinase inhibitor protein  33.97 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000771777  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  40.32 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2870  putative kinase inhibitor protein  33.97 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0113599  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00757  hypothetical protein  33.97 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259899  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  40.32 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0836  putative kinase inhibitor protein  33.97 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.145482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5877  PEBP family protein  35.9 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  33.75 
 
 
157 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  31.97 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1794  PEBP family protein  37.25 
 
 
210 aa  82  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3314  PEBP family protein  37.59 
 
 
179 aa  82  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  36.75 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0921  putative kinase inhibitor protein  33.33 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168155  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1141  PEBP family protein  33.53 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4694  PBP family phospholipid-binding protein  34.16 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2579  putative kinase inhibitor protein  33.33 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0939329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>