271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1620 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  100 
 
 		 191 aa  317  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  100 
 
 		 155 aa  316  7e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  60.53 
 
 		 179 aa  201  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  61.15 
 
 		 157 aa  199  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  61.94 
 
 		 188 aa  197  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  62 
 
 		 156 aa  196  7.999999999999999e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  54.55 
 
 		 157 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  63.82 
 
 		 157 aa  174  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  61.78 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  61.04 
 
 		 159 aa  167  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  61.04 
 
 		 159 aa  167  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  59.09 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  50.66 
 
 		 176 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  51.33 
 
 		 176 aa  163  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  58.44 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  49.03 
 
 		 193 aa  159  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  44.74 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  50 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0803  PEBP family protein  59.24 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  46.41 
 
 		 175 aa  148  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  52.67 
 
 		 181 aa  148  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  48.41 
 
 		 157 aa  148  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  45.75 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  44.08 
 
 		 194 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0756  PBP family phospholipid-binding protein  57.96 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0807  PEBP family protein  58.6 
 
 		 159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270972  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  51.61 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  48.41 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  45.81 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  52.26 
 
 		 184 aa  141  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  44.74 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  45.39 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  44.44 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  44.44 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  47.37 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  44.08 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  45.45 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  45.45 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  44.22 
 
 		 206 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  39.74 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  44.23 
 
 		 150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  44.37 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  47.02 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  37.34 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  42.58 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  42.58 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  37.82 
 
 		 173 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  41.29 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  40 
 
 		 194 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  42.11 
 
 		 191 aa  117  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  40.76 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  40.94 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  38.96 
 
 		 181 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  39.62 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  39.47 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  38.27 
 
 		 617 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  36.67 
 
 		 153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  43.23 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  38.73 
 
 		 182 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  38.73 
 
 		 182 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  38.73 
 
 		 182 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  38.96 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  38.03 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1447  PEBP family protein  42.36 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0873  PBP family phospholipid-binding protein  41.36 
 
 		 207 aa  102  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547082  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  38.03 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0331  PBP family phospholipid-binding protein  36.41 
 
 		 212 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  39.61 
 
 		 158 aa  100  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  35.76 
 
 		 179 aa  99.4  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0707  PBP family phospholipid-binding protein  35.15 
 
 		 209 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.148396 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3483  PEBP family protein  41.72 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  44.26 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  35.48 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1794  PEBP family protein  38.51 
 
 		 210 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1488  PEBP family protein  37.01 
 
 		 169 aa  95.5  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4061  protein of unknown function DUF524  33.17 
 
 		 210 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  36.81 
 
 		 187 aa  95.5  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  36.81 
 
 		 187 aa  95.5  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2489  PEBP family protein  37.89 
 
 		 183 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.182632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1992  PEBP family protein  35.66 
 
 		 180 aa  94  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2643  PEBP family protein  37.89 
 
 		 183 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  37.41 
 
 		 190 aa  93.2  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1789  PBP family phospholipid-binding protein  52.63 
 
 		 177 aa  92.8  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3081  PEBP family protein  37.27 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6697  Phospholipid-binding protein-like protein  39.01 
 
 		 192 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.066957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1597  PEBP family protein  37.93 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0106  PEBP family protein  34.85 
 
 		 203 aa  92.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0330816 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  36.36 
 
 		 184 aa  92  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1308  putative kinase inhibitor protein  35.19 
 
 		 160 aa  91.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2785  PEBP family protein  37.27 
 
 		 183 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252116  normal  0.340055 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0657  PBP family phospholipid-binding protein  36.16 
 
 		 208 aa  90.9  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  37.2 
 
 		 185 aa  90.9  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0887  PEBP family protein  36.02 
 
 		 190 aa  90.9  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  38.33 
 
 		 181 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  35.44 
 
 		 190 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2774  PBP family phospholipid-binding protein  37.18 
 
 		 169 aa  90.5  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.504548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3837  YbhB and YbcL  34.75 
 
 		 190 aa  90.5  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0419  PBP family phospholipid-binding protein  31.25 
 
 		 215 aa  90.1  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0898  PEBP family protein  36.08 
 
 		 190 aa  90.5  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  37.68 
 
 		 181 aa  90.5  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>