213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0419 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0419  PBP family phospholipid-binding protein  100 
 
 		 215 aa  440  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0478  PBP family phospholipid-binding protein  84.51 
 
 		 215 aa  374  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5958  PEBP family protein  67.76 
 
 		 211 aa  303  9.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4061  protein of unknown function DUF524  68.08 
 
 		 210 aa  299  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0707  PBP family phospholipid-binding protein  64.95 
 
 		 209 aa  296  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.148396 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4694  PBP family phospholipid-binding protein  65.58 
 
 		 211 aa  290  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1855  PEBP family protein  60.93 
 
 		 210 aa  275  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.165132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2143  PEBP family protein  60 
 
 		 210 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0331  PBP family phospholipid-binding protein  60.56 
 
 		 212 aa  262  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0957  PEBP family protein  52.58 
 
 		 209 aa  238  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.206783  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0657  PBP family phospholipid-binding protein  54.17 
 
 		 208 aa  238  8e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0141  PEBP family protein  53.24 
 
 		 208 aa  231  6e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6829  PEBP family protein  51.66 
 
 		 212 aa  229  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03572  hypothetical protein  49.54 
 
 		 203 aa  206  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196707  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1371  hypothetical protein  47.64 
 
 		 204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0106  PEBP family protein  47.89 
 
 		 203 aa  195  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0330816 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1305  PEBP family protein  46.98 
 
 		 204 aa  194  7e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.234721  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  30.19 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  31.6 
 
 		 155 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  31.73 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  29.19 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00740  predicted kinase inhibitor  31.43 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0173432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2869  PEBP family protein  31.43 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2870  putative kinase inhibitor protein  31.43 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0113599  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00757  hypothetical protein  31.43 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259899  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0827  putative kinase inhibitor protein  31.43 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000771777  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0836  putative kinase inhibitor protein  31.43 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.145482  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  30 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  29.38 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0921  putative kinase inhibitor protein  30.86 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  28.99 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  31.46 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  30.24 
 
 		 156 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  29.05 
 
 		 175 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0796  putative kinase inhibitor protein  30.29 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0510178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2579  putative kinase inhibitor protein  30.29 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0939329  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  29.95 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  29.95 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  29.25 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0942  putative kinase inhibitor protein  29.71 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0887  putative kinase inhibitor protein  29.71 
 
 		 158 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0856  putative kinase inhibitor protein  29.71 
 
 		 158 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.524056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0919  putative kinase inhibitor protein  29.71 
 
 		 158 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0828  putative kinase inhibitor protein  29.71 
 
 		 158 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.354915  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  27.54 
 
 		 150 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  27.54 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  29.06 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  32.85 
 
 		 157 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  25.12 
 
 		 180 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  28.02 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  28.5 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  26.44 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  26.44 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  26.44 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  31.22 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  25.86 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  27.59 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  25.86 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  30.81 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  29.07 
 
 		 185 aa  68.2  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  28.5 
 
 		 150 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  29.47 
 
 		 179 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0033  PBP family phospholipid-binding protein  27.89 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0912  PBP family phospholipid-binding protein  29.41 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0224568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  29.05 
 
 		 154 aa  67  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  29.72 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  26.44 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3837  YbhB and YbcL  29.89 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1992  PEBP family protein  24.71 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  27.54 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  29.56 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  28.57 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  28.1 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4302  PEBP family protein  28.74 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1618  PEBP family protein  30.29 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.82166 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2196  PEBP family protein  29.89 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00567412  hitchhiker  0.00102935 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  27.05 
 
 		 157 aa  64.3  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0756  PBP family phospholipid-binding protein  34.59 
 
 		 159 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  27.59 
 
 		 179 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  25.7 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0671  PEBP family protein  28.16 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636068  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  26.92 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0904  hypothetical protein  26.76 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  25.7 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0693  PBP family phospholipid-binding protein  28.16 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0102847 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  27.59 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4884  hypothetical protein  25.58 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  31.4 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2035  putative kinase inhibitor  25.99 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  27.05 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3014  hypothetical protein  26.64 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1269  hypothetical protein  26.64 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2774  PBP family phospholipid-binding protein  28.32 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.504548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0803  PEBP family protein  35.34 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0969  hypothetical protein  26.64 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3037  hypothetical protein  26.64 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930194  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1108  hypothetical protein  26.64 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1114  phosphatidylethanolamine-binding protein  26.64 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  27.84 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1447  PEBP family protein  27.01 
 
 		 181 aa  62  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>