252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0707 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0707  PBP family phospholipid-binding protein  100 
 
 
209 aa  434  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.148396 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4061  protein of unknown function DUF524  70.05 
 
 
210 aa  321  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0419  PBP family phospholipid-binding protein  64.95 
 
 
215 aa  296  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4694  PBP family phospholipid-binding protein  66.34 
 
 
211 aa  291  6e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0478  PBP family phospholipid-binding protein  63.72 
 
 
215 aa  287  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5958  PEBP family protein  62.93 
 
 
211 aa  282  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1855  PEBP family protein  57.89 
 
 
210 aa  270  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.165132  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0331  PBP family phospholipid-binding protein  60.87 
 
 
212 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2143  PEBP family protein  57.42 
 
 
210 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0957  PEBP family protein  54.11 
 
 
209 aa  249  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.206783  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0657  PBP family phospholipid-binding protein  53.85 
 
 
208 aa  234  6e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0141  PEBP family protein  54.29 
 
 
208 aa  228  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6829  PEBP family protein  52.22 
 
 
212 aa  226  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03572  hypothetical protein  47.34 
 
 
203 aa  201  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196707  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1371  hypothetical protein  45.63 
 
 
204 aa  191  9e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1305  PEBP family protein  45.15 
 
 
204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.234721  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0106  PEBP family protein  48.85 
 
 
203 aa  186  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0330816 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  34.33 
 
 
157 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  34.3 
 
 
180 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  36.32 
 
 
188 aa  92.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  34.16 
 
 
185 aa  92  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0871  PEBP family protein  30.35 
 
 
177 aa  91.7  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.393701 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  32.34 
 
 
157 aa  91.3  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0693  PBP family phospholipid-binding protein  33.33 
 
 
164 aa  90.9  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0102847 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0671  PEBP family protein  33.33 
 
 
164 aa  90.9  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  35.03 
 
 
157 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  30.73 
 
 
193 aa  89  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  36.16 
 
 
158 aa  89  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  34.44 
 
 
179 aa  88.6  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  34.83 
 
 
150 aa  88.2  8e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  32.35 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0033  PBP family phospholipid-binding protein  31.84 
 
 
180 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00740  predicted kinase inhibitor  31.53 
 
 
158 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0173432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2869  PEBP family protein  31.53 
 
 
158 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2870  putative kinase inhibitor protein  31.53 
 
 
158 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0113599  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0836  putative kinase inhibitor protein  31.53 
 
 
158 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.145482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00757  hypothetical protein  31.53 
 
 
158 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259899  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0827  putative kinase inhibitor protein  31.53 
 
 
158 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000771777  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  33.33 
 
 
181 aa  86.3  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0921  putative kinase inhibitor protein  31.03 
 
 
158 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168155  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2579  putative kinase inhibitor protein  31.03 
 
 
158 aa  85.9  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0939329  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  33.66 
 
 
155 aa  85.5  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0796  putative kinase inhibitor protein  30.54 
 
 
158 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0510178  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  32.16 
 
 
184 aa  85.1  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2196  PEBP family protein  31.25 
 
 
180 aa  85.1  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00567412  hitchhiker  0.00102935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0019  PEBP family protein  34.12 
 
 
180 aa  84.7  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  33.66 
 
 
191 aa  84.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  31.09 
 
 
182 aa  84.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  31.09 
 
 
182 aa  84.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  32.68 
 
 
159 aa  84.7  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  32.68 
 
 
159 aa  84.7  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  31.09 
 
 
182 aa  84.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0828  putative kinase inhibitor protein  30.54 
 
 
158 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.354915  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0856  putative kinase inhibitor protein  30.54 
 
 
158 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.524056  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0942  putative kinase inhibitor protein  30.54 
 
 
158 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0919  putative kinase inhibitor protein  30.54 
 
 
158 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0887  putative kinase inhibitor protein  30.54 
 
 
158 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  31.09 
 
 
182 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0780  PEBP family protein  32.67 
 
 
162 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  31.09 
 
 
182 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0912  PBP family phospholipid-binding protein  33.88 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0224568  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  31.28 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  30.5 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1992  PEBP family protein  29.65 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5877  PEBP family protein  31.68 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0279  PBP family phospholipid-binding protein  34.68 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181285 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  30.24 
 
 
154 aa  82  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  35.33 
 
 
207 aa  82  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1618  PEBP family protein  34.5 
 
 
171 aa  82  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.82166 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  32.66 
 
 
183 aa  82  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  31.84 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  30.35 
 
 
181 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2615  YbhB and YbcL  33.73 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  32.77 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  30.85 
 
 
150 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  30.85 
 
 
150 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  32.06 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4535  PEBP family protein  31.6 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.460349  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  32.06 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  29.35 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  32.2 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3134  PEBP family protein  28.29 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  31.22 
 
 
156 aa  79  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  33.66 
 
 
159 aa  79  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12230  conserved hypothetical protein TIGR00481  34.3 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.888512  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  27.45 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  27.45 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3314  PEBP family protein  34.12 
 
 
179 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  32.77 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  30.35 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1917  PEBP family protein  28.36 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.184289 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  29.06 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001407  phospholipid-binding protein  31.21 
 
 
177 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4114  PEBP family protein  30.66 
 
 
177 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  29.61 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1246  PEBP family protein  29.56 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  32.34 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  28.86 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1447  PEBP family protein  31.4 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4403  PEBP family protein  33.73 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>