270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1391 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  368  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  68.83 
 
 
156 aa  230  7.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  65.58 
 
 
157 aa  221  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  57.06 
 
 
188 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  63.69 
 
 
157 aa  213  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  64.74 
 
 
158 aa  188  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  62.18 
 
 
157 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  62.42 
 
 
159 aa  181  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  62.42 
 
 
159 aa  181  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  60.78 
 
 
191 aa  180  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  63.06 
 
 
159 aa  178  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  60.53 
 
 
155 aa  177  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  60.78 
 
 
157 aa  177  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  48.09 
 
 
176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  50.57 
 
 
176 aa  167  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0803  PEBP family protein  58.6 
 
 
159 aa  160  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  50.66 
 
 
155 aa  160  7e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  49.38 
 
 
193 aa  160  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  51.66 
 
 
181 aa  157  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0756  PBP family phospholipid-binding protein  57.32 
 
 
159 aa  157  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  52.32 
 
 
200 aa  155  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0807  PEBP family protein  57.32 
 
 
159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270972  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  51.3 
 
 
149 aa  154  7e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  44.51 
 
 
206 aa  152  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  50.65 
 
 
149 aa  150  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  42.95 
 
 
194 aa  144  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  47.44 
 
 
150 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  40.11 
 
 
185 aa  141  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  47.44 
 
 
150 aa  141  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  48 
 
 
149 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  43.67 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  45.45 
 
 
153 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  44.74 
 
 
150 aa  137  7e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  42.41 
 
 
154 aa  135  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  42.13 
 
 
175 aa  136  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  47.06 
 
 
175 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  45.96 
 
 
156 aa  134  7.000000000000001e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  42.16 
 
 
183 aa  131  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  44.59 
 
 
153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  44.67 
 
 
191 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  40.82 
 
 
184 aa  127  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  43.92 
 
 
153 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  42.31 
 
 
150 aa  126  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  40.51 
 
 
156 aa  123  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  43.51 
 
 
150 aa  122  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  44.81 
 
 
150 aa  122  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  36.16 
 
 
173 aa  120  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  39.74 
 
 
149 aa  120  9e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  41.33 
 
 
149 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  43.51 
 
 
158 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  38.56 
 
 
153 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  42.21 
 
 
150 aa  114  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  40.65 
 
 
158 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  39.72 
 
 
192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3483  PEBP family protein  43.33 
 
 
149 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  40.41 
 
 
617 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  39.74 
 
 
155 aa  106  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  37.91 
 
 
194 aa  105  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  36.36 
 
 
181 aa  104  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  39.75 
 
 
156 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  40.88 
 
 
159 aa  100  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3837  YbhB and YbcL  37.59 
 
 
190 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.257592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  37.42 
 
 
150 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4302  PEBP family protein  37.59 
 
 
190 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  34.83 
 
 
181 aa  98.6  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0331  PBP family phospholipid-binding protein  34.33 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  34.51 
 
 
190 aa  95.5  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  34.88 
 
 
183 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  34.88 
 
 
183 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0898  PEBP family protein  34.34 
 
 
190 aa  94.4  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6697  Phospholipid-binding protein-like protein  31.69 
 
 
192 aa  94.4  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.066957  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1202  PEBP family protein  37.5 
 
 
155 aa  94  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0887  PEBP family protein  37.74 
 
 
190 aa  93.6  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  35.39 
 
 
181 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2035  putative kinase inhibitor  34.88 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  33.89 
 
 
185 aa  92  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1681  PEBP family protein  35.22 
 
 
192 aa  91.3  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  33.13 
 
 
190 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0873  PBP family phospholipid-binding protein  33.54 
 
 
207 aa  90.1  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547082  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0061  PEBP family protein  37.89 
 
 
154 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.758418  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  31.25 
 
 
207 aa  89  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1794  PEBP family protein  32.42 
 
 
210 aa  89  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  36.43 
 
 
182 aa  88.6  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  36.43 
 
 
182 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  36.43 
 
 
182 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  34.62 
 
 
179 aa  88.6  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1488  PEBP family protein  33.71 
 
 
169 aa  88.2  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1789  PBP family phospholipid-binding protein  47.37 
 
 
177 aa  87.8  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3733  PBP family phospholipid-binding protein  32.11 
 
 
184 aa  87.8  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  36.43 
 
 
182 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  36.43 
 
 
182 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0960  PEBP family protein  32.53 
 
 
190 aa  87.4  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0174403 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0707  PBP family phospholipid-binding protein  33.33 
 
 
209 aa  87  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.148396 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1322  PEBP family protein  33.12 
 
 
151 aa  87  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4277  PEBP family protein  36.48 
 
 
153 aa  87  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246525  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1597  PEBP family protein  36.59 
 
 
183 aa  86.3  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  34.19 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0871  PEBP family protein  34.48 
 
 
177 aa  86.3  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.393701 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1038  PEBP family protein  36.14 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  31.64 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>