270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2069 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  100 
 
 		 158 aa  324  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  67.92 
 
 		 159 aa  223  6e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  59.49 
 
 		 158 aa  206  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  55.97 
 
 		 159 aa  188  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  47.06 
 
 		 200 aa  131  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  46.15 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  41.77 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  47.77 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  42.24 
 
 		 193 aa  120  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  40.52 
 
 		 181 aa  117  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  40.79 
 
 		 150 aa  117  7.999999999999999e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  48.95 
 
 		 192 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  43.51 
 
 		 179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  47.37 
 
 		 181 aa  114  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  41.29 
 
 		 150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  40.76 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  44.23 
 
 		 176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  42.58 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  44.72 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  41.88 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  41.14 
 
 		 176 aa  110  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  43.67 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  37.91 
 
 		 194 aa  108  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  44.97 
 
 		 149 aa  107  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  42.58 
 
 		 150 aa  107  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  41.29 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  40.67 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  43.42 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  40.62 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  41.94 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  36.88 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  44.23 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  44.23 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  42.14 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  43.31 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  44.03 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  36.42 
 
 		 190 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  37.82 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0756  PBP family phospholipid-binding protein  44.87 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  36.71 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  40.12 
 
 		 157 aa  97.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3081  PEBP family protein  41.25 
 
 		 158 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2643  PEBP family protein  40 
 
 		 183 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  38.93 
 
 		 191 aa  95.1  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0898  PEBP family protein  35.8 
 
 		 190 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  38.06 
 
 		 149 aa  95.1  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  41.67 
 
 		 206 aa  94.4  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2785  PEBP family protein  40.62 
 
 		 183 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252116  normal  0.340055 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  38.65 
 
 		 617 aa  94  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0873  PBP family phospholipid-binding protein  37.74 
 
 		 207 aa  94  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547082  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0807  PEBP family protein  44.23 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270972  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  47.13 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4277  PEBP family protein  40.26 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0960  PEBP family protein  35.19 
 
 		 190 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174403 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  33.33 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0803  PEBP family protein  43.59 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  33.33 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  42.86 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  37.25 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1789  PBP family phospholipid-binding protein  51.61 
 
 		 177 aa  90.1  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  39.22 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  36.36 
 
 		 175 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2489  PEBP family protein  38.75 
 
 		 183 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.182632 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  38.26 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  44.8 
 
 		 191 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  36.36 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  36.71 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  39.61 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3483  PEBP family protein  42 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1700  PEBP family protein  34.91 
 
 		 185 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1038  PEBP family protein  36.48 
 
 		 187 aa  87.8  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  36.36 
 
 		 182 aa  87.4  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5877  PEBP family protein  34.81 
 
 		 175 aa  86.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  36.42 
 
 		 153 aa  87  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  39.16 
 
 		 179 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04720  phospholipid-binding protein, PBP family  36.14 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.583132  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  37.91 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  39.16 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  39.16 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  39.16 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  35.76 
 
 		 182 aa  85.5  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  32.5 
 
 		 194 aa  84.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  38.24 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0280  PBP family phospholipid-binding protein  35.15 
 
 		 182 aa  84.7  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0912  PBP family phospholipid-binding protein  47.06 
 
 		 178 aa  84  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0224568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0316  phosphatidylethanolamine-binding protein  35.76 
 
 		 159 aa  84  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7099  PEBP family protein  42.86 
 
 		 189 aa  84  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3733  PBP family phospholipid-binding protein  33.95 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  36.09 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0033  PBP family phospholipid-binding protein  37.16 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  35.46 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  35.12 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12170  hypothetical protein  34.86 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.662377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  36.75 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3288  PEBP family protein  38.06 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0439012  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3047  hypothetical protein  35.88 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  36.23 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0871  PEBP family protein  33.95 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.393701 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  36.23 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1141  PEBP family protein  38.81 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>